Молекулярное кариотипирование
- Молекулярное кариотипирование (или хромосомный микроматричный анализ) — это высокоточный метод исследования генома, который позволяет выявлять хромосомные аномалии, невидимые при традиционном кариотипировании.
Он анализирует ДНК на уровне тысяч генетических маркеров, обнаруживая микроделеции, микродупликации и другие структурные изменения.
Ключевые возможности этого метода:
1. Выявление субмикроскопических аномалий
Микроделеции/дупликации:
- Обнаружение потери или удвоения участков ДНК размером от 50–100 тыс. пар нуклеотидов (для сравнения: традиционное кариотипирование выявляет изменения от 5–10 млн пар).
Примеры:
— Синдром Ди Джорджи (делеция 22q11.2).
— Синдром Прадера-Вилли/Ангельмана (делеция 15q11-q13).
— Синдром Вольфа-Хиршхорна (делеция 4p16.3).
2. Диагностика генетических заболеваний
Необъяснимые пороки развития:
- Анализ при врождённых аномалиях (пороки сердца, черепно-лицевые дефекты).
Задержка развития и аутизм:
- Выявление генетических причин у детей с нарушениями речи, моторных навыков или поведенческими расстройствами.
Неудачные беременности:
- Определение хромосомных аномалий при повторяющихся выкидышах.
3. Пренатальная диагностика
Неинвазивные и инвазивные тесты:
- Анализ ДНК плода из ворсин хориона, амниотической жидкости или материнской крови (НИПТ).
Уточнение рисков:
- При подозрении на патологии по УЗИ или биохимическим маркерам.
4. Онкология
Соматические мутации в опухолях:
- Выявление амплификаций, делеций или LOH (потери гетерозиготности), важных для прогноза и терапии.
Пример:
— Усиление гена _HER2_ при раке молочной железы.
— Делеция 1p/19q при олигодендроглиоме.
Мониторинг рецидивов:
- Отслеживание клональной эволюции опухоли.
5. Исследования бесплодия
Причины мужского и женского бесплодия:
- Выявление микроделеций в Y-хромосоме (например, AZF-регионы) или других хромосомных аномалий.
Балансированные транслокации у родителей:
- Риск передачи несбалансированного кариотипа потомству.
6. Преимущества перед традиционным кариотипированием
Высокое разрешение:
- Обнаружение изменений в 100–1000 раз меньших, чем видно под микроскопом.
Автоматизация:
- Минимум человеческих ошибок при интерпретации.
Широкий охват:
- Анализ всего генома за один тест.
Быстрота:
- Результаты за 7–14 дней (традиционное кариотипирование требует выращивания клеток 1–2 недели).
Методы молекулярного кариотипирования
aCGH (микроматричная сравнительная геномная гибридизация):
- Сравнение ДНК пациента с контрольным образцом для выявления отклонений.
SNP-микрочипы:
- Анализ однонуклеотидных полиморфизмов (SNP) для обнаружения делеций, дупликаций и участков LOH.
NGS-подходы:
- Секвенирование нового поколения для детализации сложных случаев.
Ограничения
Не выявляет сбалансированные перестройки:
- Транслокации, инверсии без потери/приобретения ДНК (для этого нужно традиционное кариотипирование или FISH).
Не определяет точечные мутации:
- Например, замены отдельных нуклеотидов (требуется секвенирование гена).
Ложноположительные/ложноотрицательные результаты:
- Требует подтверждения альтернативными методами (ПЦР, FISH).
Примеры клинического применения
У ребёнка с задержкой развития:
- Выявление микроделеции 16p11.2, связанной с аутизмом.
При повторных выкидышах у женщины:
- Обнаружение мозаичной формы синдрома Тёрнера (45,X/46,XX).
В онкологии:
- Обнаружение делеции гена _CDKN2A_ при глиобластоме, что влияет на прогноз.
Значение
Молекулярное кариотипирование стало золотым стандартом в диагностике:
- Ускоряет выявление причин редких заболеваний.
- Позволяет назначать таргетную терапию в онкологии.
- Улучшает генетическое консультирование семей.
- Снижает долю недиагностированных случаев в клинической практике.
Этот метод особенно важен в педиатрии, неврологии и репродуктивной медицине, где точность и скорость диагностики критически важны.
В России молекулярное кариотипирование (например, с использованием метода CGH-микрочипов или SNP-микрочипов) проводят в специализированных лабораториях, которые занимаются генетическими исследованиями.
Несколько известных лабораторий и центров, где можно сделать молекулярное кариотипирование:
1. Центр генетики и репродуктивной медицины «Геномед»
- Москва
- Услуги: молекулярное кариотипирование, генетическая диагностика, преимплантационное тестирование (PGT).
Сайт: genomed.ru
2. Лаборатория «Геноаналитика»
- Москва
- Услуги: молекулярное кариотипирование, генетические тесты для детей и взрослых.
Сайт: genoanalytica.ru
3. Медико-генетический научный центр имени академика Н.П. Бочкова
- Москва
- Услуги: молекулярное кариотипирование, диагностика наследственных заболеваний.
Сайт: med-gen.ru
4. Лаборатория «Центр Молекулярной Генетики»
- Москва
- Услуги: молекулярное кариотипирование, генетические исследования.
Сайт: dnalab.ru
5. Лаборатория «Инвитро»
- Сеть лабораторий по всей России
- Услуги: молекулярное кариотипирование, генетические тесты.
Сайт: invitro.ru
6. Лаборатория «Гемотест»
- Сеть лабораторий по всей России
- Услуги: молекулярное кариотипирование, генетические исследования.
Сайт: gemotest.ru
7. Лаборатория «Ситилаб»
- Сеть лабораторий по всей России
- Услуги: молекулярное кариотипирование, генетические тесты.
Сайт: citilab.ru
8. Лаборатория «Проген»
- Санкт-Петербург
- Услуги: молекулярное кариотипирование, генетическая диагностика.
Сайт: progenlab.ru
9. Лаборатория «Биогенетика»
- Санкт-Петербург
- Услуги: молекулярное кариотипирование, генетические исследования.
Сайт: biogenetika.ru
10. Лаборатория «Эффдиагностика»
- Москва
- Услуги: молекулярное кариотипирование, генетические тесты.
Сайт: effi.ru
Перед обращением в лабораторию рекомендуется уточнить, какие именно методы молекулярного кариотипирования они используют
(CGH, SNP, NGS), а также стоимость и сроки выполнения анализа.