Ген SLC19A3
Ген SLC19A3 (Solute Carrier Family 19 Member 3) - Кодирует белок, известный как транспортер тиамина 2 (THTR-2), который обеспечивает транспорт тиамина (витамина B1) через клеточные мембраны с использованием механизма антипорта протонов.
Локализация:
- Ген расположен на хромосоме 2 человека, в регионе 2q36.3 (ранее указывался как 2q37). (https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/11136550/)
Структура:
- Ген охватывает около 32,9 кб геномной ДНК и состоит из 8 экзонов.
- Основной транскрипт (NM_025243) включает 6 экзонов и кодирует белок из 496 аминокислот с молекулярной массой около 56 кДа.
- Белок имеет 12 трансмембранных доменов с цитозольными N- и C-концами. (https://atlasgeneticsoncology.org/gene/45635/slc19a3-%28solute-carrier-family-19-%28thiamine-transporter%29-member-3%29) (https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/11136550/)
Экспрессия:
- Ген SLC19A3 экспрессируется в различных тканях человека, включая мозг, сердце, желудочно-кишечный тракт, легкие, поджелудочную железу, мышцы, яичники, яички, надпочечники, с наиболее высокой экспрессией в плаценте, печени и почках.
- У мышей экспрессия более ограничена (мозг, сердце, легкие, почки, тонкий кишечник). (https://atlasgeneticsoncology.org/gene/45635/slc19a3-%28solute-carrier-family-19-%28thiamine-transporter%29-member-3%29).
Функциональная роль:
Транспорт тиамина:
- SLC19A3 отвечает за высокоспецифичный транспорт тиамина в клетки, что критически важно для метаболизма углеводов, работы нервной системы и синтеза нейротрансмиттеров.
- Тиамин участвует в функционировании таких ферментов, как пируватдегидрогеназа и α-кетоглутаратдегидрогеназа, связывающих гликолиз с циклом трикарбоновых кислот (цикл Кребса). (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5701311/)
Механизм транспорта:
- Процесс транспорта тиамина зависит от температуры, энергии и pH, а также регулируется уровнем внеклеточного тиамина через транскрипционную регуляцию гена SLC19A3. (https://atlasgeneticsoncology.org/gene/45635/slc19a3-%28solute-carrier-family-19-%28thiamine-transporter%29-member-3%29)(https://atlasgeneticsoncology.org/gene/45635/slc19a3-%28solute-carrier-family-19-%28thiamine-transporter%29-member-3%29)
Локализация в клетке:
- В поляризованных клетках (например, эпителиальных клетках кишечника) белок THTR-2 преимущественно локализуется на апикальной мембране, обеспечивая поглощение тиамина из просвета кишечника. (https://atlasgeneticsoncology.org/gene/45635/slc19a3-%28solute-carrier-family-19-%28thiamine-transporter%29-member-3%29)
Семейство транспортеров:
SLC19A3 принадлежит к семейству транспортеров SLC19, которое включает:
SLC19A1:
- Транспортер фолатов (RFC-1).
SLC19A2:
- Транспортер тиамина 1 (THTR-1).
SLC19A3 имеет 42% и 53% идентичности аминокислотной последовательности с SLC19A1 и SLC19A2 соответственно, но не транспортирует фолаты, в отличие от SLC19A1, и имеет более высокое сродство к тиамину (Kt ~25 нМ) по сравнению с SLC19A2 (Kt около 2,5 мкМ). (https://www.sciencedirect.com/topics/biochemistry-genetics-and-molecular-biology/slc19a3)
Регуляция:
- Промотор SLC19A3 в клетках кишечника человека содержит ключевой сайт связывания SP1/GC-box (позиция -48/-45 bp), который взаимодействует с факторами SP1 и SP3, обеспечивая транскрипционную активность. (https://www.sciencedirect.com/topics/biochemistry-genetics-and-molecular-biology/slc19a3)
- Регуляция подтверждена как in vitro, так и in vivo на трансгенных мышах.
Эпигенетическая регуляция:
- Гиперметилирование промотора SLC19A3 связано с пониженной экспрессией гена в клеточных линиях рака желудка и тканях карциномы. (https://atlasgeneticsoncology.org/gene/45635/slc19a3-%28solute-carrier-family-19-%28thiamine-transporter%29-member-3%29)
Заболевания, связанные с мутациями SLC19A3
- Мутации в гене SLC19A3 ассоциированы с несколькими неврологическими расстройствами, вызванными нарушением транспорта тиамина.
Основные заболевания:
1. Биотин-тиамин-чувствительная болезнь базальных ганглиев (BTBGD, Thiamine Metabolism Dysfunction Syndrome 2, THMD2):
Описание:
- Аутосомно-рецессивное нейрометаболическое заболевание, характеризующееся прогрессирующей нейродегенерацией, включая субострую энцефалопатию, судороги, дисфагию, дистонию, спутанность сознания и, при отсутствии лечения, кому и смерть. (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5701311/)
Клинические проявления:
- Обычно начинается в раннем детстве, хотя описаны случаи с младенческим началом.
- Симптомы могут быть спровоцированы стрессорами, такими как лихорадка, травмы или вакцинация. (https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28962040/)
Патология:
- Двусторонний некроз в области головки хвостатого ядра и путамена, выявляемый на МРТ. (https://www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?gene=SLC19A3)
Лечение:
- Высокие дозы биотина (5-20 мг/кг/день) и/или тиамина (10-40 мг/кг/день) эффективны при раннем начале терапии, предотвращая прогрессирование симптомов.
- Задержка лечения может привести к остаточной параплегии, легкой когнитивной дисфункции или дистонии.
- Тиамин в одиночку часто так же эффективен, как комбинация с биотином. (https://www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?gene=SLC19A3) (https://www.frontiersin.org/journals/genetics/articles/10.3389/fgene.2021.683255/full)
Мутации:
- Более 23 новых мутаций описаны в китайской когорте, включая миссенс-мутации и делеции (например, p.G23V, 4808-bp делеция в 5’-регионе). (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5701311/) (https://www.frontiersin.org/journals/genetics/articles/10.3389/fgene.2021.683255/full)
2. Энцефалопатия, подобная Вернике:
- Характеризуется неврологическими симптомами, схожими с энцефалопатией Вернике, включая спутанность сознания, атаксию и офтальмоплегию.
- Часто связана с гомозиготными или компаунд-гетерозиготными мутациями SLC19A3. (https://bmcmedgenet.biomedcentral.com/articles/10.1186/1471-2350-11-171)
3. Раннемладенческая летальная энцефалопатия:
- Проявляется тяжелой энцефалопатией с быстрым ухудшением неврологических функций вскоре после рождения, дыхательной недостаточностью и смертью.
- На МРТ наблюдаются отек базальных ядер, таламусов, коры и ствола мозга с последующей дегенерацией белого вещества. (https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23482991/)
4. Младенческие судороги и прогрессирующая атрофия мозга:
- Начинается в раннем младенчестве с эпилептических спазмов, тяжелой психомоторной задержкой и атрофией мозга. (https://bmcmedgenet.biomedcentral.com/articles/10.1186/1471-2350-11-171)
5. Синдром, подобный Лея:
- Некоторые пациенты с мутациями SLC19A3 демонстрируют симптомы, схожие с синдромом Лея, включая лактат-ацидоз и поражение базальных ганглиев. (https://medlineplus.gov/genetics/gene/slc19a3/)
Эпидемиология:
- BTBGD чаще всего встречается в популяциях Саудовской Аравии (52% зарегистрированных случаев), что связано с высокой частотой гомозиготной мутации T422A.
- В других регионах, включая Китай, заболевание реже, но имеет более разнообразный спектр мутаций. (https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28962040/) (https://www.frontiersin.org/journals/genetics/articles/10.3389/fgene.2021.683255/full)
Диагностика:
Биомаркеры:
- Сниженный уровень свободного тиамина в спинномозговой жидкости (CSF) при нормальном уровне в крови является потенциальным маркером. (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5701311/)
Молекулярное тестирование:
- Секвенирование SLC19A3 для выявления мутаций является золотым стандартом диагностики. (https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28962040/)
МРТ:+
- Характерные изменения в базальных ганглиях, таламусах и стволе мозга. (https://bmcmedgenet.biomedcentral.com/articles/10.1186/1471-2350-11-171)
Связанные исследования и материалы
1. Функциональные исследования:
- Исследования показали, что SLC19A3 обеспечивает высокоспецифичный транспорт тиамина, но не биотина, несмотря на название заболевания (BTBGD).
- Эксперименты не подтвердили способность белка транспортировать биотин. (https://www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?gene=SLC19A3)
- Взаимодействие THTR-2 с белком TM4SF4 в кишечнике усиливает поглощение тиамина. (https://atlasgeneticsoncology.org/gene/45635/slc19a3-%28solute-carrier-family-19-%28thiamine-transporter%29-member-3%29)
- Исследование на мышах с делецией Slc19a3 показало нарушение распределения тиамина в тканях и изменения метаболизма мозга, подчеркивая роль гена в гомеостазе тиамина. (https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23482991/)
2. Генетические исследования:
- Идентификация SLC19A3 как гена, ответственного за BTBGD, была проведена в 2005 году (Zeng et al.). (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5701311/)
- Целогеномное секвенирование выявило новые мутации, включая компаунд-гетерозиготные варианты (p.G23V и 4808-bp делеция), подтверждающие диагноз BTBGD у пациентов с прогрессирующей нейродегенерацией. (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5701311/)
- В китайской когорте из 18 пациентов с THMD2 было описано 23 новых мутации, расширяющих генетический спектр заболевания. (https://www.frontiersin.org/journals/genetics/articles/10.3389/fgene.2021.683255/full)
3. Клинические исследования:
- Исследование Kevelam et al. (2013) выявило связь мутаций SLC19A3 с раннемладенческой летальной энцефалопатией с характерным МРТ-паттерном (отек базальных ядер и последующая атрофия). (https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23482991/)
- Tabarki et al. (2013) пересмотрели клинические, радиологические и генетические аспекты BTBGD, подтвердив эффективность биотина и тиамина при раннем лечении. (https://medlineplus.gov/genetics/gene/slc19a3/)
- Wang et al. (2021) провели обзор 146 случаев THMD2, выделив фенотипы, включая классический BTBGD, младенческий синдром Лея и лактат-ацидоз новорожденных. (https://www.frontiersin.org/journals/genetics/articles/10.3389/fgene.2021.683255/full)
4. Эпигенетические исследования:
- Гиперметилирование промотора SLC19A3 связано с пониженной экспрессией в раке желудка и молочной железы, что делает его потенциальным биомаркером для диагностики рака. (https://atlasgeneticsoncology.org/gene/45635/slc19a3-%28solute-carrier-family-19-%28thiamine-transporter%29-member-3%29)
- Экзогенная экспрессия SLC19A3 в клетках рака молочной железы повышает чувствительность к доксорубицину и радиационно-индуцированному апоптозу. (https://atlasgeneticsoncology.org/gene/45635/slc19a3-%28solute-carrier-family-19-%28thiamine-transporter%29-member-3%29)
5. Фармакологические исследования:
- Клиническое исследование (ClinicalTrials.gov) изучало влияние ингибиторов SLC19A3 (например, метформина и триметоприма) на фармакокинетику тиамина, используя секвенирование SLC19A3 для выявления однонуклеотидных полиморфизмов (SNPs). (https://classic.clinicaltrials.gov/ct2/show/NCT03746106)
- Исследования показали, что тиаминовые тиоэфиры могут быть перспективными для замедления прогрессирования нейродегенеративных заболеваний, связанных с дефицитом тиамина. (https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23482991/)
6. Модели на животных:
- Мurine Slc19a3 картирован на хромосому 1 мыши в регионе, связанном с восприимчивостью к судорогам у штамма DBA/2J, что делает его кандидатным геном для исследований эпилепсии. (https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/11136550/)
- Исследования на мышах с нокаутом Slc19a3 показали фенотипические изменения, связанные с нарушением транспорта тиамина, включая метаболические изменения в мозге. (https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23482991/)
7. Базы данных и ресурсы:
GeneCards:
- Предоставляет полную информацию о функции, белках, путях, ортологах и экспрессии SLC19A3.
NCBI Gene:
- Подробные данные о гене, включая аннотации и транскрипты.
MedlinePlus Genetics:
- Информация о роли гена и связанных заболеваниях.
The Human Protein Atlas:
- Данные об экспрессии белка THTR-2 в тканях.
GTEx Portal:
- Информация об экспрессии гена в различных тканях.
ClinicalTrials.gov:
- Данные о клинических исследованиях, связанных с SLC19A3.
Рекомендации и будущие направления исследований
1. Международный регистр:
- Создание международного регистра пациентов с дефектами SLC19A3 для дальнейшего изучения клинических и генетических аспектов заболевания.
2. Биомаркеры:
- Исследование уровня свободного тиамина в CSF как надежного диагностического маркера.
3. Терапия:
- Дальнейшее изучение эффективности тиамина и биотина, а также разработка новых тиаминовых производных для лечения нейродегенеративных расстройств.
4. Эпигенетика:
- Изучение роли метилирования промотора SLC19A3 как биомаркера рака и его терапевтического потенциала.
5. Фармакогенетика:
- Исследование влияния полиморфизмов SLC19A3 на метаболизм лекарств, таких как метформин.