Ген SLC20A1
Ген SLC20A1 (Solute Carrier Family 20 Member 1) - Кодирует белок, известный как натрий-фосфатный симпортер 1 (PiT-1), который играет ключевую роль в транспорте неорганического фосфата через клеточные мембраны и выполняет функции рецептора для определённых ретровирусов.
1. Общее описание гена SLC20A1
Название:
- Solute Carrier Family 20 Member 1 (SLC20A1).
Синонимы:
- GLVR-1 (Gibbon Ape Leukemia Virus Receptor 1), PiT-1.
Локализация:
- Ген SLC20A1 расположен на хромосоме 2 человека (2q13).
Функция белка:
Натрий-фосфатный симпортер:
- SLC20A1 кодирует мембранный белок, который обеспечивает активный транспорт неорганического фосфата (Pi) в клетки в натрий-зависимом режиме.
- Фосфат необходим для клеточного метаболизма, синтеза нуклеиновых кислот, липидов и сигнальной трансдукции.
Рецептор ретровирусов:
- Белок PiT-1 служит рецептором для вирусов, таких как вирус лейкемии гиббонов (GALV), вирус саркомы обезьян (SSAV), вирус лейкемии кошек подгруппы B (FeLV-B) и вирус мышей 10A1 (MuLV), что делает клетки, экспрессирующие SLC20A1, восприимчивыми к этим вирусам.
Структура белка:
- PiT-1 это мультиспановый мембранный белок с несколькими трансмембранными доменами.
- Участок, называемый "регион A" в четвёртой внеклеточной петле, критичен для функции рецептора ретровирусов.
Экспрессия:
- Ген экспрессируется в различных тканях, с высокой экспрессией в костном мозге, плаценте, сосудистых гладкомышечных клетках и других тканях, где требуется транспорт фосфата.
2. Биологическая роль и молекулярные пути
Транспорт фосфата:
- SLC20A1 вместе с родственником SLC20A2 (PiT-2) относится к семейству натрий-зависимых фосфатных транспортеров типа III и выполняют "домашнюю" функцию, поддерживая гомеостаз фосфата в клетках.
Участие в минерализации:
- SLC20A1 связан с процессами минерализации в хондробластах, остеобластах и сосудистых гладкомышечных клетках.
- Дисрегуляция SLC20A1 может приводить к патологической кальцификации, например, в сосудах или плаценте.
Роль в онкологии:
- Высокая экспрессия SLC20A1 ассоциирована с плохим прогнозом при некоторых видах рака (например, раке простаты, груди, языка и поджелудочной железы).
- Ген участвует в пролиферации клеток, прогрессии клеточного цикла и подавлении апоптоза.
Связанные молекулярные пути:
- Транспорт неорганических катионов/анионов и аминокислот/олигопептидов.
- Метаболизм глюкозы и энергии.
- Сигнальные пути, связанные с кальцификацией и онкогенезом.
3. Ассоциированные заболевания
Онкологические заболевания:
- Высокая экспрессия SLC20A1 коррелирует с плохим прогнозом при раке простаты, раке молочной железы (особенно при эндокринной терапии и радиотерапии) и других типах опухолей.
- Исследования показывают, что SLC20A1 способствует жизнеспособности раковых клеток и формированию опухолевых сфер у стволовых клеток рака молочной железы. (https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC10316049/)
- В исследованиях рака простаты (на основе данных TCGA) установлено, что экспрессия SLC20A1 выше в опухолевой ткани по сравнению с нормальной простатической тканью, а мутации включают миссенс-мутации и делеции. (https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC10316049/)
Патологическая кальцификация:
- Дисрегуляция SLC20A1 связана с кальцификацией аортального клапана и сосудов.
- Исследования показали, что SLC20A1 (PiT-1) вместе с PiT-2 транскрипционно регулируется фактором ATF4, способствуя минерализации сосудистых гладкомышечных клеток. (http://www.labome.org/gene/human/slc20a1-6574.html)
- В моделях мышей с нокаутом Slc20a1 наблюдается летальность на стадии эмбрионального развития, связанная с аномалиями сосудистой системы, задержкой роста и анемией. (https://www.informatics.jax.org/marker/MGI:108392)
Ретровирусные инфекции:
- Как рецептор для GALV и FeLV-B, SLC20A1 играет роль в восприимчивости клеток к этим вирусам, что имеет значение для исследований генной терапии и ретровирусных векторов.
Другие патологии:
- Связь с эндометриозом и экспериментальным циррозом печени (у ортологов). (https://rgd.mcw.edu/rgdweb/report/gene/main.html?id=621079)
- Потенциальная роль в гипофосфатемии и дефиците гормонов гипофиза (например, в сочетании с мутациями SLC15A4). (http://www.labome.org/gene/human/slc20a1-6574.html)
- Мутации SLC20A1 могут быть связаны с эписпадией или экстрофией мочевого пузыря. (https://en.wikipedia.org/wiki/SLC20A1)
4. Исследовательские материалы и ключевые публикации
Основные направления исследований:
1. Онкология:
- Исследование 2023 года (PMC) показало, что высокая экспрессия SLC20A1 ассоциирована с плохим прогнозом при раке простаты.
- Анализ данных TCGA и SU2C-PCF выявил корреляцию между экспрессией SLC20A1 и клиническими исходами, включая выживаемость без прогрессирования заболевания (PFS) и общую выживаемость (OS). (https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC10316049/)
- В исследованиях рака молочной железы установлено, что SLC20A1 способствует позднему рецидивированию опухолей с положительным рецептором эстрогена при эндокринной терапии. (https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC10316049/)
- Потеря функции SLC20A1 в клеточных линиях (HeLa, HepG2, MCF-7) снижает жизнеспособность клеток и усиливает апоптоз, что подтверждает его онкогенную роль. (https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC10316049/)(https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC10316049/)
2. Кальцификация и минерализация:
- Исследование 2016 года (JCI Insight) выявило, что SLC20A1 (PiT-1) и SLC20A2 (PiT-2) регулируются транскрипционным фактором ATF4, способствуя минерализации сосудистых гладкомышечных клеток. (http://www.labome.org/gene/human/slc20a1-6574.html)
- В моделях мышей с дефицитом Slc20a2 наблюдалось ограничение роста плода и кальцификация плаценты, что подчеркивает роль SLC20A1/2 в транспорте фосфата в плаценте. (http://www.labome.org/gene/human/slc20a1-6574.html)
3. Ретровирусные рецепторы и генная терапия:
- Исследования 1990-х годов (Palmer et al., 1999; Kavanaugh et al., 1996) охарактеризовали SLC20A1 как рецептор для GALV и FeLV-B и используется в разработке ретровирусных векторов для генной терапии. (https://www.wikigenes.org/e/gene/e/6574.html)
- Регуляция экспрессии SLC20A1 может улучшать эффективность доставки генов в клетки, особенно в клетки с высокой экспрессией гена (например, K562 и LAD EBV B-клетки). (https://www.wikigenes.org/e/gene/e/6574.html)
4. Фенотипы и нокауты:
- В базе данных International Mouse Phenotyping Consortium (IMPC) описаны фенотипы мышей с нокаутом Slc20a1, включая эмбриональную летальность, аномалии сосудов и анемию. (https://www.informatics.jax.org/marker/MGI:108392)
- Анализ транскриптома гипофиза мышей (Simm et al., 2018) выявил SLC20A1 как потенциальный фактор риска комбинированного дефицита гормонов гипофиза. (http://www.labome.org/gene/human/slc20a1-6574.html)
Ключевые базы данных и ресурсы
NCBI Gene:
- Подробная информация о SLC20A1, включая последовательности, экспрессию и аннотации. (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene?Db=gene&Cmd=DetailsSearch&Term=6574) (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene?term=6574)
GeneCards:
- Полная информация о гене, включая функции, пути, фенотипы и продукты для исследований (например, CRISPR-киты, антитела). (https://www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?gene=SLC20A1)
Ensembl:
- Данные о транскриптах, ортологах и фенотипах SLC20A1 в разных организмах. (http://www.ensembl.org/Mus_musculus/Gene/Summary?db=core&g=ENSMUSG00000027397&r=2:129199144-129199816&t=ENSMUST00000148988) (http://www.ensembl.org/Mus_musculus/Gene/Summary?g=ENSMUSG00000027397&r=2%253A129198764-129211616)
TCGA и Oncomine:
- Источники для анализа экспрессии SLC20A1 в опухолях. (https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC10316049/)
RCSB PDB:
- Структурные данные белка PiT-1. (http://www.rcsb.org/pdb/gene/SLC20A1)
Ma'ayan Laboratory (Harmonizome):
- Функциональные ассоциации SLC20A1 с биологическими процессами и заболеваниями. (https://maayanlab.cloud/Harmonizome/gene/SLC20A1)
PubMed:
- Основной источник научных публикаций, включая исследования по онкологии, кальцификации и ретровирусным рецепторам.
Инструменты и продукты для исследований
CRISPR и RNAi:
- Доступны CRISPR-киты (Synthego, VectorBuilder) и shRNA-векторы (OriGene, Santa Cruz Biotechnology) для нокаута или подавления экспрессии SLC20A1. (https://www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?gene=SLC20A1)
Антитела:
- LifeSpan BioSciences предлагает 17 антител и 3 белка для SLC20A1. (https://www.lsbio.com/targets/slc20a1/g2912)
Векторы и вирусы:
- VectorBuilder и Applied Biological Materials предоставляют лентивирусные, аденовирусные и AAV-векторы для экспрессии или нокаута SLC20A1. (https://www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?gene=SLC20A1)
5. Перспективы исследований
1. Онкология:
- Изучение SLC20A1 как биомаркера для прогнозирования исходов рака и ответа на терапию (например, эндокринную терапию и радиотерапию).
- Разработка ингибиторов SLC20A1 для подавления пролиферации опухолевых клеток.
2. Кальцификация:
- Исследование роли SLC20A1 в патологической кальцификации сосудов и разработка терапевтических стратегий для предотвращения атеросклероза и кальцификации клапанов.
3. Генная терапия:
- Оптимизация ретровирусных векторов, использующих SLC20A1 как рецептор, для повышения эффективности доставки генов.
4. Фосфатный гомеостаз:
- Изучение регуляции SLC20A1 в контексте гипофосфатемии и других нарушений фосфатного обмена.
Заключение
Ген SLC20A1 - играет важную роль в транспорте фосфата, минерализации тканей, онкогенезе и ретровирусной инфекции.
Дисрегуляция гена SLC20A1 связана с рядом патологий, включая рак, сосудистую кальцификацию и эмбриональные аномалии.
Исследования SLC20A1 активно проводятся в области онкологии, генной терапии и молекулярной биологии, с использованием данных TCGA, модельных организмов и современных генетических инструментов.