+7 (953) 870-47-02
Отправить письмо
С 9:00 до 21:00 Без выходных

  • Ваша корзина пуста!

  • Ген SLC22A11

Ген SLC22A11

Ген SLC22A11

Ген SLC22A11 - OAT4 - organic anion transporter 4 - Кодирует белок, участвующий в транспорте органических анионов.

Ген SLC22A11 расположен на хромосоме 11q13.1 у человека и активно изучается в контексте метаболизма, транспорта лекарств и связанных заболеваний, таких как подагра и остеопороз.

Ниже представлено подробное описание гена и обзор связанных исследований, основанный на анализе научных баз данных и публикаций, актуальных на 29 апреля 2025 года.


1. Связанные исследования

  • Исследования показывают, что ген SLC22A11 связан с уровнями мочевой кислоты в крови, подагрой и другими заболеваниями.
  • Включая изучение однонуклеотидных полиморфизмов (SNPs), которые могут влиять на транспорт лекарств, особенно у пациентов с остеопорозом.
  • Также исследовались разные механизмы транспорта, включая встраивание эстрона-сульфата в мембрану по сравнению с транспортом мочевой кислоты.
  • Для получения дополнительной информации посетите NCBI Gene, PubChem или Harmonizome.


2. Подробное описание гена SLC22A11

Ген SLC22A11 имеет следующие ключевые характеристики, извлеченные из базы данных NCBI:

Официальный символ:

  • SLC22A11

Полное название:

  • solute carrier family 22 member 11

Альтернативные названия:

  • OAT4, hOAT4

ID гена:

  • 55867, обновлено 7 апреля 2025 года

Тип гена:

  • Кодирующий белок

Организм:

  • Homo sapiens

Локализация:

  • Хромосома 11q13.1, NC_000011.10: 64555941-64572875 (сборка GRCh38.p14), количество экзонов: 10
  • Предыдущая сборка: NC_000011.9: 64323413-64340347 (GRCh37.p13)
  • T2T-CHM13v2.0 Локализация: NC_060935.1: 64548682-64565616

Краткое описание:

  • Белок, кодируемый геном SLC22A11, участвует в натрий-независимом транспорте и выведении органических анионов, которые могут быть токсичными.
  • Он преимущественно экспрессируется в почках и плаценте, где, вероятно, предотвращает попадание вредных органических анионов к плоду.
  • Альтернативный сплайсинг приводит к нескольким транскриптным вариантам. [Источник: RefSeq, апрель 2015]

Экспрессия:

  • Высокая экспрессия в плаценте (RPKM 19.0) и почках (RPKM 17.4), данные доступны в Genome Data Viewer.

Связанные базы данных:

Клоны:

  • MGC34282

Транскрипты и белки:

  • Изоформа 1: NM_018484.4 - NP_060954.1, 523 аминокислоты, CCDS8074.1
  • Изоформа 2: NM_001307985.2 - NP_001294914.1, укороченная, CCDS76425.1
  • Изоформа X1: XM_011545167.2 - XP_011543469.1, T2T-CHM13v2.0
  • UniProtKB: Q9NSA0 (основной), также A8K426, Q53GR2, Q6ZP72, Q8NBU4; TrEMBL: A6NCG2

Процессы по Gene Ontology:

  • Транспорт неорганических анионов (IEA), транспорт моноатомных ионов (IEA), транспорт органических анионов (IBA, IDA, PubMed 10660625, PubMed 15291761), транспорт простагландинов (IDA, PubMed 11907186), метаболизм мочевой кислоты (IMP, PubMed 19503597), трансмембранный транспорт (IEA).

Компоненты по Gene Ontology:

  • Апикальная плазматическая мембрана (IDA, IEA, PubMed 15037815), базальная плазматическая мембрана (IEA), внешняя сторона плазматической мембраны (IDA, PubMed 15102942), экстрацеллюлярный экзосом (HDA, PubMed 19056867), мембрана (IEA), плазматическая мембрана (IDA, IEA, TAS, PubMed 10660625).

Фенотипы:

  • Связан с концентрациями мочевой кислоты в сыворотке, подагрой, факторами риска сердечно-сосудистых заболеваний, ожирением у детей в латиноамериканской популяции, данные доступны в EBI GWAS Catalog.


3. Связанные исследования

  • Исследования гена SLC22A11 охватывают его роль в транспорте органических анионов, генетические вариации и их влияние на здоровье.

Идентификация и характеризация SNPs гена SLC22A11 у корейских женщин с остеопорозом:

    Опубликовано:

    • Molecules and Cells, Том 25, Выпуск 2, Апрель 2008, Страницы 265-271
    • DOI: https://doi.org/10.1016/S1016-8478(23)17580-7
    • Исследование включало 50 здоровых женщин и 50 с остеопорозом, где использовались GC-clamp PCR и электрофорез в градиенте денатурации (DGGE).

    Были выявлены три SNPs:

    • C483A, G832A (в группе с остеопорозом) и C847T (в контрольной группе).
    • SNP G832A является несинонимичным (nsSNP), изменяющим 278-ю аминокислоту с глутаминовой кислоты на лизин (E278K).
    • Функциональные тесты показали снижение поглощения [3H] эстрона-сульфата у мутанта E278K по сравнению с дикого типа: Km для дикого типа 0.7 пМ, Vmax 1.8 пмоль/ооцит/ч; для E278K: Km 1.2 пМ, Vmax 0.47 пмоль/ооцит/ч.

    Заключение:

    • Варианты hOAT4 могут вызывать индивидуальные различия в поглощении анионных лекарств и использоваться как маркеры, включая остеопороз.

    Ключевые слова:

    • DGGE, эстрон-сульфат, GC-clamp, hOAT4, остеопороз, полиморфизм.

    Новый механизм действия SLC22A11: встраивание эстрона-сульфата в мембрану по сравнению с транслокацией мочевой кислоты и глутамата:

      Опубликовано:

      • Biochemical Pharmacology, Том 128, Страницы 74-82, 15 Марта 2017
      • DOI: https://doi.org/10.1016/j.bcp.2016.12.020
      • Исследование сосредоточено на механизмах транспорта эстрона-сульфата (E3S) и мочевой кислоты (UA) через SLC22A11.
      • Транспорт E3S в 20 раз быстрее, чем UA.
      • Высвобождение глутамата (Glu) подавляется экстрацеллюлярным E3S, но не UA.
      • Высвобождение E3S стимулируется дегидроэпиандростерон-сульфатом (DHEAS), но не UA или 6-карбоксифлуоресцеином (6CF).
      • Накопление E3S в равновесии увеличивается в 3 раза при замене хлорида на глюконат, в то время как для UA эффект обратный.

      Редактор-Генетики, [29.04.2025 15:11]:

      • Поглощение E3S гиперболическое, что указывает на встраивание в плазматическую мембрану, в отличие от линейного поглощения UA и 6CF.
      • Экспрессия SLC22A11 обнаружена в почках и плаценте (северный блот), белок локализован в апикальной мембране проксимальных канальцев и базолатеральной мембране синцитиотрофобласта.
      • Связан с уровнями UA в сыворотке по данным геномно-ассоциативных исследований.
      • Эффективность транспорта: поглощение E3S и DHEAS в ооцитах Xenopus увеличено в ~10 раз, K_m = 1 мкМ для E3S, 0.6 мкМ для DHEAS; для UA увеличение в 5 раз в ооцитах, в 293 клетках в 1.7 раза, специфическая клиренсность = 0.013 мкл мин-1 мг белка-1.
      • Сравнение с другими субстратами: E3S (M_r = 349, log P = 3.1) больше и гидрофобнее, чем типичные субстраты SLC22, такие как UA (M_r = 167).
      • Указано 18 других транспортеров, транспортирующих E3S (Таблица 1 в статье).
      • Финансирование: Университетская больница Кёльна, конфликты интересов отсутствуют.

      Эффективность транспорта:

      • Поглощение E3S и DHEAS в ооцитах Xenopus увеличено в ~10 раз, K_m = 1 мкМ для E3S, 0.6 мкМ для DHEAS; для UA увеличение в 5 раз в ооцитах, в 293 клетках в 1.7 раза, специфическая клиренсность = 0.013 мкл мин-1 мг белка-1.

      Сравнение с другими субстратами:

      • E3S (M_r = 349, log P = 3.1) больше и гидрофобнее, чем типичные субстраты SLC22, такие как UA (M_r = 167).
      • Указано 18 других транспортеров, транспортирующих E3S (Таблица 1 в статье).

      Финансирование:

      • Университетская больница Кёльна, конфликты интересов отсутствуют.


      4. Дополнительные ресурсы и базы данных

      • Помимо указанных исследований, существуют другие источники информации о гене SLC22A11.
      • Harmonizome: Предоставляет функциональные ассоциации для SLC22A11 из 74 наборов данных, охватывая 8 категорий, таких как молекулярный профиль, заболевания, фенотипы.
      • PubChem: Содержит информацию о генетической мишени, включая связанные заболевания и соединения, протестированные в биоанализах.
      • GeneCards: Предоставляет полную информацию о гене SLC22A11.
      • Genetics Home Reference (NIH): Предоставляет обзор гена SLC22A11.
      • Для поиска дополнительных исследований рекомендуется использовать PubMed, введя запрос "SLC22A11" или "OAT4".


      5. Таблица: Ключевые характеристики гена SLC22A11

      Категория Детали
      Официальный символ SLC22A11
      Полное название solute carrier family 22 member 11
      Также известен как OAT4, hOAT4
      ID гена 55867, обновлено 7 апреля 2025
      Тип гена кодирующий белок
      Локализация Хромосома 11q13.1, NC_000011.10: 64555941-64572875 (GRCh38.p14)
      Экспрессия Преимущественно в плаценте и почках (RPKM 19.0 и 17.4 соответственно)
      Фенотипы Уровни мочевой кислоты, подагра, риски ССЗ, ожирение у детей (латиноамериканцы)


      Заключение

      Ген SLC22A11 играет важную роль в транспорте органических анионов, с акцентом на почки и плаценту.

      Исследования показывают его связь с уровнями мочевой кислоты, подагрой и потенциальными маркерами, такими как SNPs для остеопороза.

      Разные механизмы транспорта, включая для E3S и UA, подчеркивают сложность его функций, требующую дальнейших исследований.

      Доступные базы данных, такие как NCBI, PubChem и Harmonizome, предоставляют обширную информацию для углубленного анализа.


      Ключевые цитирования