Ген SLC22A12
Альтернативные названия:
- RST, UAT, OAT4L, URAT1, hURAT1
Локализация:
- Расположен на хромосоме 11q13.1, содержит 9 экзонов, с геномной позицией GRCh38.p14: NC_000011.10 (64591220..64602344).
Экспрессия:
- Ген преимущественно экспрессируется в почках, с высоким уровнем экспрессии в проксимальных канальцах (RPKM 60.9).
Мутации и заболевания:
- Мутации в гене ассоциированы с почечной гипоурикемией типа 1 (MedGen: C0473219, OMIM: 220150), характеризующейся низким уровнем мочевой кислоты в крови.
- Вариации гена связаны с гиперурикемией и подагрой, особенно у азиатских популяций.
Альтернативный сплайсинг:
- Ген дает несколько вариантов транскриптов, включая изоформы a, b, c, d, и дополнительные варианты X1, X2, что отражено в базах данных, таких как (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/116085).
Ассоциированные условия и геномно-ассоциативные исследования
- Ген SLC22A12 активно изучается в контексте геномно-ассоциативных исследований (GWAS).
Например:
- Геномно-ассоциативные анализы идентифицировали 18 новых локусов, связанных с концентрацией сывороточного урата (EBI GWAS Catalog).
- Исследование среди афроамериканцев выявило геномные риски и новый аллель с потерей функции URAT1, связанный с подагрой (EBI GWAS Catalog).
- Мета-анализ 28 141 человека выявил общие варианты в пяти новых локусах, влияющих на концентрацию мочевой кислоты (EBI GWAS Catalog).
- Исследования подчеркивают важность гена в регуляции уровня мочевой кислоты и его потенциальную роль в развитии подагры и связанных с ней состояний.
Связанные исследования и материалы
Обзор ключевых исследований, связанных с геном SLC22A12, доступных на платформах, таких как (https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/):
Исследование | Описание | Популяция/Фокус | PMID (если доступно) |
The SLC22A12 gene is associated with gout in Han Chinese and Solomon Islanders | Анализирует связь гена с подагрой в разных популяциях. | Китайцы, Соломоновы острова | 19762362 |
Genetic epidemiological analysis of hypouricaemia from 4993 Japanese | Изучает нефункциональные варианты гена и гипоурикемию. | Японцы | 34255816 |
Substantial anti-gout effect conferred by common and rare dysfunctional variants | Оценивает защитный эффект вариантов гена против подагры. | Разные популяции | 33821957 |
Identification of a dysfunctional splicing mutation in SLC22A12/URAT1 gene | Описывает мутацию, вызывающую почечную гипоурикемию типа 1. | Две семьи | - |
Associations between SLC22A12 gene and gout susceptibility: a meta-analysis | Мета-анализ, подтверждающий связь полиморфизмов с подагрой. | Разные популяции | 29352852 |
- Эти исследования доступны через (https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/), где можно найти полные тексты для углубленного анализа.
- Ген изучался в моделях животных, таких как крысы и мыши, что отражено в базах данных, таких как (https://rgd.mcw.edu/rgdweb/report/gene/main.html?id=621628) и (https://www.informatics.jax.org/marker/MGI:1195269).
- Эти ресурсы предоставляют данные о фенотипах, экспрессии и взаимодействиях гена, что полезно для исследований его функции.
Дополнительные ресурсы
Для углубленного изучения гена SLC22A12 рекомендуется использовать следующие платформы:
- (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/116085) для детальной информации о структуре, функциях и транскриптах.
- (http://www.rcsb.org/pdb/gene/SLC22A12) для изучения структурных данных, связанных с белком, кодируемым геном.
- (https://www.antibodypedia.com/gene/15487/SLC22A12) для информации об антителах, полезных для лабораторных исследований.
Заключение
Ген SLC22A12 - играет центральную роль в метаболизме мочевой кислоты, и его вариации имеют значительное влияние на развитие таких заболеваний, как почечная гипоурикемия типа 1 и подагра.
Исследования гена SLC22A12, проведенные на разных популяциях, особенно в Азии, подтверждают его важность.
Доступные ресурсы, такие как (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/116085), (https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/) и специализированные базы данных, предоставляют обширные материалы для дальнейших исследований.
Ключевые цитирования