Ген SLC22A12
Ген SLC22A12 (Solute Carrier Family 22 Member 12) - Кодирует белок, играющий ключевую роль в транспорте мочевой кислоты через клеточные мембраны, особенно в эпителиальных клетках проксимальных канальцев почек.
Ген SLC22A12 также известен как URAT1 (urate transporter 1), является объектом активных исследований в области генетики и метаболизма.
1. Связанные исследования
- Исследования, включая геномно-ассоциативные исследования, показывают, что вариации в гене SLC22A12 влияют на риск подагры, особенно у азиатских популяций.
- Включая данные о связи гена с гиперурикемией у японцев и китайцев.
- Вы можете найти подробности в базах данных, таких как NCBI Gene или PubMed, где доступны статьи о гене.
2. Подробное описание гена SLC22A12
- Ген SLC22A12 относится к семейству транспортеров органических анионов (OAT) и имеет следующие характеристики:
Официальное название:
- solute carrier family 22 member 12.
Альтернативные названия:
- RST, UAT, OAT4L, URAT1, hURAT1.
Тип гена:
- Кодирующий белок.
Организм:
- Homo sapiens.
Локализация:
- расположен на хромосоме 11q13.1, содержит 9 экзонов, с геномной позицией GRCh38.p14: NC_000011.10 (64591220..64602344).
Функция:
- Кодирует уратный транспортер, который регулирует уровень мочевой кислоты в крови, участвуя в ее транспорте через мембраны клеток.
- Этот процесс критически важен для поддержания гомеостаза мочевой кислоты.
Экспрессия:
- Ген преимущественно экспрессируется в почках, с высоким уровнем экспрессии в проксимальных канальцах (RPKM 60.9).
Мутации и заболевания:
- Мутации в гене ассоциированы с почечной гипоурикемией типа 1 (MedGen: C0473219, OMIM: 220150), характеризующейся низким уровнем мочевой кислоты в крови.
- Также вариации гена связаны с гиперурикемией и подагрой, особенно у азиатских популяций.
Альтернативный сплайсинг:
- Ген дает несколько вариантов транскриптов, включая изоформы a, b, c, d, и дополнительные варианты X1, X2, что отражено в базах данных, таких как NCBI Gene.
- Функционально, ген участвует в процессах, таких как клеточный ответ на стимул инсулина, транспорт моноатомных ионов, и метаболизм мочевой кислоты.
- Он локализован в апикальной плазматической мембране и мембране щеточной каймы, что подтверждается данными из Gene Ontology (GO).
3. Ассоциированные условия и геномно-ассоциативные исследования
- Ген SLC22A12 активно изучается в контексте геномно-ассоциативных исследований (GWAS).
- Геномно-ассоциативные анализы идентифицировали 18 новых локусов, связанных с концентрацией сывороточного урата (EBI GWAS Catalog).
- Исследование среди афроамериканцев выявило геномные риски и новый аллель с потерей функции URAT1, связанный с подагрой (EBI GWAS Catalog).
- Мета-анализ 28 141 человека выявил общие варианты в пяти новых локусах, влияющих на концентрацию мочевой кислоты (EBI GWAS Catalog).
Редактор-Генетики, [29.04.2025 15:13]:
- Эти исследования подчеркивают важность гена в регуляции уровня мочевой кислоты и его потенциальную роль в развитии подагры и связанных с ней состояний.
4. Связанные исследования и материалы
Ниже представлен обзор ключевых исследований, связанных с геном SLC22A12, доступных на платформах, таких как PubMed и специализированные базы данных:
Исследование | Описание | Популяция/Фокус | PMID (если доступно) |
---|---|---|---|
The SLC22A12 gene is associated with gout in Han Chinese and Solomon Islanders | Анализирует связь гена с подагрой в разных популяциях. | Китайцы, Соломоновы острова | 19762362 |
Genetic epidemiological analysis of hypouricaemia from 4993 Japanese | Изучает нефункциональные варианты гена и гипоурикемию. | Японцы | 34255816 |
Substantial anti-gout effect conferred by common and rare dysfunctional variants | Оценивает защитный эффект вариантов гена против подагры. | Разные популяции | 33821957 |
Identification of a dysfunctional splicing mutation in SLC22A12/URAT1 gene | Описывает мутацию, вызывающую почечную гипоурикемию типа 1. | Две семьи | - |
Associations between SLC22A12 gene and gout susceptibility: a meta-analysis | Мета-анализ, подтверждающий связь полиморфизмов с подагрой. | Разные популяции | 29352852 |
- Эти исследования доступны через PubMed, где можно найти полные тексты для углубленного анализа.
- Ген SLC22A12 изучался в моделях животных, таких как крысы и мыши, что отражено в базах данных, таких как Rat Genome Database и Mouse Genome Informatics.
- Эти ресурсы предоставляют данные о фенотипах, экспрессии и взаимодействиях гена, что полезно для исследований его функции.
5. Дополнительные ресурсы
Для углубленного изучения гена SLC22A12 рекомендуется использовать следующие платформы:
- NCBI Gene для детальной информации о структуре, функциях и транскриптах.
- RCSB PDB для изучения структурных данных, связанных с белком, кодируемым геном.
- Antibodypedia для информации об антителах, полезных для лабораторных исследований.
Заключение
Ген SLC22A12 играет центральную роль в метаболизме мочевой кислоты, и его вариации имеют значительное влияние на развитие таких заболеваний, как почечная гипоурикемия типа 1 и подагра.
Исследования, проведенные на разных популяциях, особенно в Азии, подтверждают его важность.
Доступные ресурсы, такие как NCBI, PubMed и специализированные базы данных, предоставляют обширные материалы для дальнейших исследований.
Ключевые цитирования
- NCBI Gene detailed information on SLC22A12
- Rat Genome Database for Slc22a12 gene
- Mouse Genome Informatics for Slc22a12 gene
- PubMed article on SLC22A12 and gout in Han Chinese
- PubMed article on hypouricaemia and SLC22A12 variants
- PubMed article on anti-gout effects of SLC22A12 variants
- PubMed meta-analysis on SLC22A12 and gout susceptibility