Ген SLC22A3
Ген SLC22A3 (Solute Carrier Family 22 Member 3) - Кодирует белок, относящийся к семейству переносчиков растворенных веществ (SLC).
Ген SLC22A3 также известен как органический катионный транспортер 3 (OCT3) или экстранейрональный моноаминовый транспортер (EMT).
Ген SLC22A3 играет важную роль в транспорте различных органических катионов, включая нейротрансмиттеры, лекарства и токсины, через клеточные мембраны.
Локализация:
- Ген SLC22A3 расположен на хромосоме 6 человека в регионе 6q25.3-6q27. Он входит в кластер из трех генов катионных транспортеров (SLC22A1, SLC22A2, SLC22A3), которые находятся в тесной физической близости. AtlasGenetics
Структура гена:
- SLC22A3 состоит из 11 экзонов и 10 интронов. Он кодирует белок длиной 551 аминокислоты с молекулярной массой около 61 кДа. AtlasGenetics
Белковый продукт:
- Белок SLC22A3 представляет собой интегральный мембранный белок с 12 предполагаемыми α-спиральными трансмембранными доменами (TMD).
- Оба конца белка (NH2 и COOH) расположены на цитоплазматической стороне плазматической мембраны. Между TMD1 и TMD2 находится большой внеклеточный домен (106 аминокислот) с тремя потенциальными сайтами N-гликозилирования (позиции 72, 99 и 114). AtlasGenetics
Функция:
- SLC22A3 - это полиспецифический транспортер органических катионов, который участвует в транспорте эндогенных молекул (например, нейротрансмиттеров: дофамина, норадреналина, эпинефрина, серотонина, гистамина) и экзогенных веществ (лекарств, токсинов). GeneCards
- Ген SLC22A3 играет ключевую роль в выведении этих соединений через печень, почки, кишечник и другие органы.
Экспрессия гена
SLC22A3 экспрессируется в различных тканях, что подчеркивает его системную роль в гомеостазе и фармакокинетике.
Основные ткани экспрессии:
- Плацента (особенно на базолатеральной мембране эпителия). ScienceDirect
- Печень (синусоидальная мембрана гепатоцитов). ScienceDirect
- Почки.
- Легкие (люминальная мембрана бронхиального эпителия). ScienceDirect
- Сердце.
- Скелетные мышцы.
- Мозг (нейроны, глиальные клетки, эпителий сосудистого сплетения). ScienceDirect
Другие ткани:
- Кишечник.
- Мочевой пузырь.
- Молочные железы.
- Кожа.
- Кровеносные сосуды.
- Опухолевые клетки. ScienceDirect
Особенности экспрессии:
- В плаценте SLC22A3 высоко экспрессируется в первом триместре, но уровень экспрессии снижается к концу беременности. PubMed
- Экспрессия гена регулируется эпигенетическими механизмами, включая метилирование CpG-островков в промоторе, что может снижать экспрессию в некоторых раковых клетках (например, при раке простаты). AtlasGenetics
Функции и биологическая роль
SLC22A3 участвует в транспорте широкого спектра молекул, что делает его важным для:
Фармакокинетика:
- Транспортирует клинически значимые препараты, такие как метформин (противодиабетический препарат), оксиплатин (противоопухолевый препарат), ламвудин (противовирусный препарат) и нейротоксин 1-метил-4-фенилпиридиний (MPP+). GeneCards
- Способствует выведению катионных лекарств и токсинов через почки и печень. SinoBiological
- Может влиять на специфичность действия противоопухолевых препаратов, таких как оксиплатин. GeneCards
Нейротрансмиссия:
- SLC22A3 участвует в системе uptake-2 (низкоаффинной, высокоемкостной), которая обеспечивает клиренс нейротрансмиттеров (дофамин, норадреналин, эпинефрин, серотонин, гистамин) в центральной нервной системе. AtlasGenetics
- Может играть роль в модуляции нейродегенеративных процессов за счет транспорта дофамина. ScienceDirect
Плацентарный транспорт:
- Регулирует материнско-фетальный транспорт катионных соединений, защищая плод от потенциально токсичных веществ. ScienceDirect
Метаболизм ксенобиотиков:
- Участвует в выведении токсинов из организма, что особенно важно для почек, которые подвержены риску опухолевого развития из-за высокой экспозиции ксенобиотиков. AtlasGenetics
Эпигенетическая регуляция
Метилирование промотора:
Промотор SLC22A3 содержит крупный CpG-островок, который простирается в экзон 1. AtlasGenetics
Аномальное метилирование этого региона связано со снижением экспрессии гена, например, при раке простаты. AtlasGenetics
Импринтинг:
В плаценте мыши некодирующая РНК Air специфически подавляет экспрессию отцовского аллеля Slc22a3, взаимодействуя с промотором и гистоновой метилтрансферазой H3K9, что демонстрирует моноаллельную экспрессию (материнский аллель активен). AtlasGenetics GenomicsEngland
Гистоновая модификация:
В плаценте описана роль серотонилового транспортера в регуляции транскриптома, связанного с развитием нервной системы, через модификацию гистонов. JAX
Связь с заболеваниями
SLC22A3 ассоциирован с рядом патологий, включая онкологические, неврологические и сердечно-сосудистые заболевания.
Онкологические заболевания:
Рак толстой кишки:
Генетический вариант rs7758229 в SLC22A3 связан с повышенной восприимчивостью к колоректальному раку в японской популяции, но не в китайской. Вариант rs420038 G>A ассоциирован с пониженным риском колоректального рака и снижением экспрессии SLC22A3. AtlasGenetics NCBI
Рак простаты:
- Аномальное метилирование промотора SLC22A3 снижает экспрессию гена, что может способствовать прогрессии опухоли. AtlasGenetics
Рак поджелудочной железы:
- Высокая экспрессия SLC22A3 коррелирует с более длительной общей выживаемостью у пациентов, получавших нуклеозидные аналоги (например, гемцитабин).
- SLC22A3 может служить фармакогеномным биомаркером для прогнозирования эффективности химиотерапии. ScienceDirect
Рак почек:
- Экспрессия SLC22A3 влияет на резистентность почечных карцином к химиотерапии. AtlasGenetics
Гепатоцеллюлярная карцинома:
- SLC22A3 ассоциирован с развитием этого типа рака. AtlasGenetics
Неврологические расстройства:
Обсессивно-компульсивное расстройство (ОКР):
- Генетические варианты SLC22A3 (например, Met370Ile и -106/107delAG) связаны с 40% снижением транспорта норадреналина и могут играть роль в патогенезе ОКР.
- Ген локализован в регионе 6q26-q27, который перекрывается с геномной областью, связанной с ОКР. AtlasGenetics
Нейродегенеративные заболевания:
- SLC22A3 может модулировать нейродегенерацию за счет транспорта дофамина, но механизмы требуют дальнейшего изучения. ScienceDirect
Сердечно-сосудистые заболевания:
- Кластер генов SLC22A3-LPAL2-LPA является локусом восприимчивости к ишемической болезни сердца. AtlasGenetics
Зависимость от метамфетамина (MAP):
- Полиморфизмы SLC22A3 могут быть связаны с зависимостью от метамфетамина, так как ген транспортирует этот психостимулятор. AtlasGenetics
Другие ассоциации:
- Сахарный диабет 1 типа и генетические заболевания (например, 3-метилглутациновая ацидурия с глухотой, энцефалопатией и синдромом, подобным Лея). GeneCards RGD
- Инфекции коксаки-вирусом и почечные новообразования (на основе ортологов). RGD
Полиморфизмы и мутации
Однонуклеотидные полиморфизмы (SNP):
rs7758229:
- Ассоциирован с риском колоректального рака в японской популяции. AtlasGenetics
rs420038 G>A:
- Снижает риск колоректального рака и экспрессию SLC22A3. NCBI
rs3088442:
- Увеличивает риск тяжелого орального мукозита у пациентов с множественной миеломой, получающих мелфалан. ResearchGate
rs2504938, rs9364554, rs2457571:
- Ассоциированы с риском рака поджелудочной железы, хотя некоторые ассоциации не прошли коррекцию на множественное тестирование. ResearchGate
Мутации:
- Мутации Met370Ile и -106/107delAG снижают транспорт норадреналина на 40% и связаны с ОКР. AtlasGenetics
- Наличие редких несинонимичных SNP в кодирующей области может влиять на функцию OCT3 и фармакокинетику катионных препаратов. ScienceDirect
Клиническое значение:
- Мутации, снижающие экспрессию или функцию SLC22A3, могут уменьшать выведение катионных лекарств через печень и материнско-фетальный барьер, а также снижать эффективность метформина. ScienceDirect
- Ингибиторы OCT3 могут использоваться для подавления кардиотоксичности препаратов, являющихся субстратами SLC22A3. ScienceDirect
Исследования и материалы
SLC22A3 активно изучается в контексте фармакогеномики, онкологии, неврологии и эпигенетики.
Фармакогеномика:
- Исследования роли SLC22A3 в транспорте метформина, оксиплатина и других препаратов.
- Статья Ghaffari-Cherati et al (2016) изучает связь полиморфизмов SLC22A3 с ответом на метформин у пациентов с диабетом 2 типа. PubMed
- Исследование Mohelnikova-Duchonova et al. (2017) показывает связь SNP rs2504938 с выживаемостью пациентов с раком поджелудочной железы. ResearchGate
Онкология:
- Геномные исследования ассоциаций (GWAS) выявили роль SLC22A3 в восприимчивости к колоректальному раку, раку простаты и ишемической болезни сердца. ScienceDirect
- Работа Chen et al. (2013) демонстрирует, что метилирование промотора SLC22A3 снижает экспрессию гена при раке простаты. AtlasGenetics
Неврология:
- Исследования Lazar et al. (2008) связывают мутации SLC22A3 с ОКР, подчеркивая его роль в транспорте нейротрансмиттеров. AtlasGenetics
- Статья Schildkraut and Mooney (2004) описывает роль SLC22A3 в системе uptake-2 для клиренса нейротрансмиттеров. AtlasGenetics
Эпигенетика:
- Nagano et al. (2008) изучили роль некодирующей РНК Air в импринтинге Slc22a3 у мышей. AtlasGenetics
- Chan et al. (2024) исследовали влияние серотонилового транспортера на гистоновую модификацию и экспрессию Slc22a3 в плаценте. JAX
Модели и инструменты:
- Использование CRISPR/Cas9 для создания нокаутных моделей SLC22A3 (например, мышиные линии от Cyagen или CRISPR-продукты от Synthego). GeneCards
- Антитела против SLC22A3 (например, от Creative Biolabs) для изучения экспрессии белка. GeneCards
Перспективы исследований
Фармакогеномика:
- Дальнейшее изучение роли SLC22A3 в индивидуализированной медицине, особенно для оптимизации терапии метформином, оксиплатином и другими препаратами.
Онкология:
- Исследование SLC22A3 как биомаркера для прогнозирования ответа на химиотерапию и выживаемости при раке поджелудочной железы и других опухолях.
Неврология:
- Углубленное изучение роли SLC22A3 в нейродегенеративных заболеваниях и психических расстройствах, таких как ОКР.
Эпигенетика:
- Исследование механизмов импринтинга и эпигенетической регуляции SLC22A3 в различных тканях и патологических состояниях.
Полезные ресурсы
Базы данных:
- NCBI Gene: NCBI Gene
- GeneCards: GeneCards
- The Human Protein Atlas: ProteinAtlas
- Rat Genome Database: RGD
Научные статьи:
- Verhaagh et al. (1999): Клонирование SLC22A3 у мышей и человека. PubMed
- Chen et al. (2013): Эпигенетическая регуляция SLC22A3 при раке простаты. AtlasGenetics
- Mohelnikova-Duchonova et al. (2017): Полиморфизмы SLC22A3 и рак поджелудочной железы. ResearchGate
Инструменты:
Заключение
Ген SLC22A3 - Кодирует важный транспортер органических катионов, который играет ключевую роль в фармакокинетике, нейротрансмиссии и выведении токсинов.
Экспрессия гена SLC22A3 в различных тканях, включая плаценту, печень, почки и мозг, подчеркивает его системную значимость.
Полиморфизмы и мутации SLC22A3 связаны с онкологическими, неврологическими и сердечно-сосудистыми заболеваниями, а также с фармакологическими ответами на препараты.
Эпигенетическая регуляция, включая метилирование и импринтинг, добавляет дополнительный уровень сложности к его функциям.
Активные исследования SLC22A3 в области фармакогеномики, онкологии и неврологии открывают перспективы для разработки новых терапевтических подходов и биомаркеров.