Ген SLC22A5

Ген SLC22A5 (organic cation/carnitine transporter 2) - Кодирует белок OCTN2, который играет ключевую роль в транспорте карнитина в клетки, что необходимо для окисления жирных кислот и производства энергии, особенно в сердце и мышцах и является объектом активных исследований в области генетики и метаболизма. 

Ген SLC22A5 активно экспрессируется в почках, кишечнике, сердце и других тканях.

Мутации в гене могут привести к дефициту карнитина, что вызывает проблемы, такие как мышечная слабость и гипогликемию.

Также есть данные, что некоторые варианты гена могут быть связаны с болезнью Крона, хотя это требует дополнительных исследований.

Связанные исследования

• Исследования показывают, что ген SLC22A5 изучался в контексте его роли в транспорте карнитина и связи с заболеваниями.
• Есть работы, которые исследуют, как мутации влияют на уровень карнитина и вызывают дефицит, а также как ген может быть связан с воспалительными заболеваниями кишечника.
• Материалы доступны на платформах, таких как (https://medlineplus.gov/genetics/gene/slc22a5/) и (https://www.sciencedirect.com/topics/biochemistry-genetics-and-molecular-biology/slc22a5).

Подробное описание гена SLC22A5

Официальное название и алиасы:

• Ген SLC22A5 также известен как CDSP (системный дефицит карнитина), OCTN2, SCD (системный дефицит карнитина), solute carrier family 22 member 5.

Местоположение:

• Расположен на хромосоме 5q31.1, что подтверждено данными из (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/6584).

Структура гена:

• Содержит 11 экзонов, что отражено в геномных координатах GRCh38.p14: NC_000005.10 (132369710..132395612).

Экспрессия:

• Высокая экспрессия наблюдается в почках (RPKM 17.3), тонком кишечнике (RPKM 11.3) и других тканях, таких как сердце, печень, мышцы, согласно данным (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/6584).
• Также экспрессия обнаружена в эпителиальных клетках, мышечных клетках, глиальных клетках, нейронах и эндотелиальных клетках сердца, что подтверждается исследованиями на (https://www.sciencedirect.com/topics/biochemistry-genetics-and-molecular-biology/slc22a5).

Связанные заболевания:

Первичный дефицит карнитина (CDSP):

• Мутации в гене SLC22A5 вызывают системный первичный дефицит карнитина (OMIM:212140), аутосомно-рецессивное заболевание, что приводит к снижению уровня карнитина, нарушая окисление жирных кислот и энергетический обмен.
• Симптомы включают гипокетотическую гипогликемию, синдром Рея, внезапную смерть младенцев в раннем возрасте, а также кардиомиопатию и прогрессирующую мышечную слабость позже в жизни. Подробности доступны на (https://medlineplus.gov/genetics/condition/primary-carnitine-deficiency/).

Болезнь Крона:

• Некоторые варианты SLC22A5, особенно SNP в промоторной области (-207G → C), связаны с повышенным риском болезни Крона.
• SNP нарушает активность фактора транскрипции HSF1 и демонстрирует связь с другими полиморфизмами, такими как SNP в гене OCTN1 (1672C → T), что подтверждено исследованиями (https://www.sciencedirect.com/topics/biochemistry-genetics-and-molecular-biology/slc22a5).
• Уменьшение экспрессии OCTN2 наблюдается при воспалительных заболеваниях кишечника и целиакии.

Генетические вариации:

• В гене выявлены многочисленные несинонимные SNP и SNP в промоторной области.
• SNP -207G → C связан с болезнью Крона, а другие варианты могут увеличивать риск сердечной недостаточности у пациентов с гипертонией, воспалительными заболеваниями кишечника и энцефалопатией, связанной с гриппом, согласно данным на (https://www.sciencedirect.com/topics/biochemistry-genetics-and-molecular-biology/slc22a5).

Регуляция:

• Экспрессия SLC22A5 регулируется эстрогеном (через эстроген-отзывные элементы в интроне), HSF1 и PPARγ.
• Уровень экспрессии может увеличиваться при голодании или при лечении фибратами, такими как клофибрат, что подтверждается исследованиями (https://www.sciencedirect.com/topics/biochemistry-genetics-and-molecular-biology/slc22a5).

Связанные исследования

• Исследования гена SLC22A5 охватывают широкий спектр тем, включая его клонирование, функцию, генетические вариации и связь с заболеваниями.

Таблица с ключевыми аспектами исследований:

• Дополнительные исследования включают изучение экзосомального OCTN2, его роли в воспалительных заболеваниях почек и возможной функции в сигнальной передаче между клетками, что подтверждается данными на (https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0009898118305813).
• Также ген SLC22A5 расположен в локусе IBD5 на хромосоме 5q31, что связано с первичным дефицитом карнитина и воспалительными заболеваниями кишечника.

Заключение

Ген SLC22A5 - играет критическую роль в метаболизме, обеспечивая транспорт карнитина и поддерживая энергетический обмен.

Мутации в гене связаны с серьезными заболеваниями, такими как первичный дефицит карнитина и, возможно, болезнь Крона.

Исследования продолжают изучать его функции, генетические вариации и потенциальные терапевтические подходы, что делает его важным объектом для будущих исследований.

Ключевые цитирования

1. (https://medlineplus.gov/genetics/gene/slc22a5/)
2. (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/6584)
3. (https://www.sciencedirect.com/topics/biochemistry-genetics-and-molecular-biology/slc22a5)
4. (https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0009898118305813)