Ген SLC22A7
Ген SLC22A7 (Solute Carrier Family 22 Member 7) - Кодирует белок Organic Anion Transporter 2 (OAT2), который является частью семейства переносчиков солей (SLC22).
Ген SLC22A7 расположен на хромосоме 6p21.1 у человека и играет ключевую роль в транспорте органических анионов через клеточные мембраны, особенно в печени и почках.
Данный отчет предоставляет подробное описание гена, его функций, экспрессии, клинической значимости и связанных исследований, основываясь на доступных научных данных на апрель 2025 года.
1. Подробное описание гена SLC22A7
Официальное название и символ:
- SLC22A7, Solute Carrier Family 22 Member 7.
Тип гена:
- Кодирующий белок, с 13 экзонами.
Локализация:
- Хромосома 6p21.1, позиция NC_000006.12: 43295714..43305538 (сборка GRCh38.p14).
Транскрипты и белки:
- Имеет два основных транскрипта: NM_006672.3 → NP_006663.2 (изоформа a, 521 аминокислота) и NM_153320.2 → NP_696961.2 (изоформа b, 523 аминокислоты).
- Эти изоформы связаны с идентификаторами в базах, включая UniProt (Q9Y694).
Функция:
- Белок OAT2 участвует в натрий-независимом транспорте органических анионов, включая потенциально токсичные вещества, включая простагландины (E2, F2-alpha), креатинин, cGMP (циклический гуанозинмонофосфат), мочевая кислота, тетрациклин, буметанид, эстронсульфат, глутарат, дегидроэпиандростеронсульфат, аллопуринол, 5-фторурацил, паклитаксел, L-аскорбиновая кислота, салицилат, метотрексат и альфа-кетоглутарат.
Экспрессия:
- Высоко выражена в печени (RPKM 51.8) и почках (RPKM 19.9), с меньшей экспрессией в других тканях, включая эритроциты.
- Ген SLC22A7 подчеркивает его роль в детоксикации и выведении отходов.
Клеточные компоненты:
- Локализован в апикальной плазматической мембране, базолатеральной плазматической мембране, базальной плазматической мембране, цитоплазме, цитозоле, мембране и плазматической мембране, согласно аннотациям Gene Ontology (GO).
Процессы:
- Участвует в транспорте органических анионов, транспорте простагландинов, транспорте альфа-кетоглутарата, транспорте моноатомных ионов, трансмембранном транспорте и метаболизме ксенобиотиков.
2. Клиническая значимость
Связанные заболевания:
- Исследования связывают SLC22A7 с подагрой и нарушениями обмена билирубина.
- В базе GeneCards указано, что ген ассоциирован с этими состояниями, хотя механизмы требуют дальнейшего изучения.
Генетические варианты:
- Имеются несинонимичные полиморфизмы, включая Thr101Ile, Ver192Ile и Gly507Asp, с частотами аллелей 6%, 6% и 5% в субсахарской Африке, Индо-Пакистане и Японии соответственно (SLC22A7 - an overview | ScienceDirect Topics).
- Исследования, включая Vormfelde et al. (2006), показывают, что эти варианты, кажется, не существенно влияют на индивидуальную вариабельность ответа на лекарства или восприимчивость к заболеваниям через изменение почечного выведения субстратных препаратов, включая торсемида.
Кардиотоксичность:
- Исследование Visscher et al. (2015) выявило ассоциацию вариантов SLC22A7 с антрациклин-индуцированной кардиотоксичностью у детей, улучшая модель предсказания риска (Genetic variants in SLC22A17 and SLC22A7 are associated with anthracycline-induced cardiotoxicity in children).
3. Связанные пути и взаимодействия
Пути:
- Участвует в путях, включая транспорт неорганических катионов/анионов и аминокислот/олигопептидов, активность фторпиримидина и фармакокинетика/фармакодинамика, согласно GeneCards.
Взаимодействия:
- Интеракции включают вещества, включая (+)-шизандрин B, 17альфа-этинилэстрадиол, 17бета-эстрадиол, согласно базе Rat Genome Database (Slc22a7 (solute carrier family 22 member 7) - Rat Genome Database).
4. Связанные исследования и материалы
Ниже представлен список ключевых исследований, которые изучают SLC22A7, с кратким описанием их фокуса и ключевых выводов:
Название исследования | Источник | Год | Фокус | Ключевой вывод |
---|---|---|---|---|
Characterization of Organic Anion Transporter 2 (SLC22A7): A Highly Efficient Transporter for Creatinine | Drug Metabolism and Disposition | 2015 | Роль в транспорте креатинина и локализация в почках | Высокоэффективный транспорт креатинина, выше, чем у OCT2, MATE1, MATE2K. |
Organic Anion Transporter 2 (SLC22A7) Is a Facilitative Transporter of cGMP | Molecular Pharmacology | 2008 | Транспорт cGMP, второго мессенджера | Высокая предпочтительность к cGMP, Km 88 ± 11 μM. |
Systems Biology Analysis Reveals Eight SLC22 Transporter Subgroups, Including OATs, OCTs, and OCTNs | International Journal of Molecular Sciences | 2020 | Классификация SLC22, SLC22A7 в подгруппе OATS2 | Уникальный профиль субстратов, включая простагландины, креатинин, мочевую кислоту. |
Renal Organic Anion Transporters (SLC22 Family): Expression, Regulation, Roles in Toxicity, and Impact on Injury and Disease | The AAPS Journal | 2012 | Обзор SLC22, включая роль SLC22A7 в почечной секреции мочевой кислоты | Участвует в секреции мочевой кислоты, согласно Sato et al. (2010). |
Emerging Roles of the Human Solute Carrier 22 Family | Pharmacological Reviews | 2024 | Роли SLC22, включая SLC22A7, и влияние генетических вариантов | Подчеркивает роль в транспорте органических анионов и клинические последствия. |
- Эти статьи доступны через базы, включая PubMed (Characterization of Organic Anion Transporter 2 (SLC22A7)) и Springer (Renal Organic Anion Transporters (SLC22 Family)).
5. Дополнительные ресурсы
- Для дальнейшего изучения доступны авторитетные базы данных, включая:
- NCBI Gene Database для детальной информации о гене.
- GeneCards для функций, белков, расстройств, путей, ортологов и экспрессии.
- Human Protein Atlas для данных об экспрессии в тканях.
Заключение
Ген SLC22A7 играет важную роль в транспорте органических анионов, особенно в печени и почках, с потенциальным влиянием на метаболические и токсические процессы.
Связанные исследования подчеркивают его значение в транспорте креатинина, cGMP и мочевой кислоты, а также возможные клинические приложения, включая предсказание риска кардиотоксичности.
Для углубленного анализа рекомендуется обратиться к указанным статьям и базам данных.
Ключевые цитирования
- Characterization of Organic Anion Transporter 2 (SLC22A7) highly efficient creatinine transporter
- Genetic variants in SLC22A17 and SLC22A7 associated with anthracycline-induced cardiotoxicity
- SLC22A7 overview with expression and polymorphisms data
- Renal organic anion transporters SLC22 family expression and roles
- NCBI Gene Database detailed SLC22A7 information
- GeneCards comprehensive SLC22A7 gene information
- Human Protein Atlas SLC22A7 expression summary
- Slc22a7 solute carrier family 22 member 7 rat data