Ген SLC23A1
Ген SLC23A1 (Solute Carrier Family 23 Member 1) - Кодирует белок, который является одним из двух натрий-зависимых транспортеров витамина С (SVCT1) в организме человека. (https://en.wikipedia.org/wiki/SLC23A1)
Белок SVCT1 играет ключевую роль в транспорте витамина С (аскорбиновой кислоты) через эпителиальные поверхности, обеспечивая его всасывание и распределение в органах.
Ранее ген имел обозначение SLC23A2, но позже был переименован в SLC23A1 для уточнения его функции и отличия от другого транспортера витамина С, кодируемого геном SLC23A2 (SVCT2).
1. Общая информация о гене SLC23A1
Название:
- Solute Carrier Family 23 Member 1
Локализация:
- Хромосома 5, локус 5q31.2-31.3
Размер гена:
- Ген охватывает около 50 кб геномной ДНК и содержит 17 экзонов.
Кодируемый белок:
- SVCT1 (Sodium-dependent Vitamin C Transporter 1), состоящий из 598 аминокислот.
Функция:
- Натрий-зависимый котранспорт аскорбиновой кислоты с соотношением 2 Na⁺ на одну молекулу аскорбата.
- Обеспечивает активный транспорт витамина С через эпителиальные барьеры, такие как кишечник и почки, играя важную роль в поддержании гомеостаза витамина С в организме.
Экспрессия:
- Высокая экспрессия наблюдается в эпителиальных тканях, включая кишечник, почки, печень, а также в головном мозге, что подчеркивает его роль в абсорбции витамина С из кишечника и реабсорбции в почках.
2. Структура и молекулярные характеристики
Геномная структура:
Ген состоит из 17 экзонов, из которых экзон 3 содержит стартовый кодон трансляции. Размеры экзонов варьируются от 58 до 4407 пар оснований.(https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/11214969/)
Белок SVCT1:
- Мембранный белок с 12 трансмембранными доменами. (https://www.sciencedirect.com/topics/biochemistry-genetics-and-molecular-biology/slc23a1)
- Высокая гомология с ортологами у других млекопитающих (например, мышей, крыс, коров).
- Специфичен для транспорта аскорбиновой кислоты, но не нуклеобаз (в отличие от других членов семейства NAT - Nucleobase-Ascorbate Transporter).
Изоформы:
- Существуют альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, кодирующие разные изоформы белка. (https://www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?gene=SLC23A1)
- Изоформа 2 является неактивным транспортером.
Регуляция:
- Экспрессия гена регулируется на транскрипционном и эпигенетическом уровнях. (https://www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?gene=SLC23A1)
- Стимуляция протеинкиназой С (PMA) приводит к 10-кратному снижению накопления аскорбата в клетках, экспрессирующих SVCT1.
3. Функции и биологическая роль
Транспорт витамина С:
- SVCT1 отвечает за активный транспорт аскорбиновой кислоты в клетки, особенно в кишечнике (всасывание из пищи) и почках (реабсорбция для предотвращения потерь с мочой), что критически важно для поддержания системного уровня витамина С, который является мощным антиоксидантом и кофактором для многих ферментов.(https://www.sciencedirect.com/topics/biochemistry-genetics-and-molecular-biology/slc23a1)
Антиоксидантная защита:
- Витамин С, транспортируемый SVCT1, участвует в защите клеток от окислительного стресса, что особенно важно для тканей с высокой метаболической активностью, таких как мозг.(https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/11214969/)
Метаболические пути:
- Участвует в метаболизме водорастворимых витаминов и кофакторов. (https://www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?gene=SLC23A1)
- Связан с сигнальным путем PAK (p21-активируемая киназа).
Роль в мозге:
- Высокая экспрессия SVCT1 в нейронах подчеркивает его значение для защиты мозга от окислительного стресса, что может быть связано с нейродегенеративными заболеваниями.(https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/11214969/)
4. Связанные заболевания и генетические вариации
Ген SLC23A1 ассоциирован с рядом заболеваний и патологических состояний, что подтверждается исследованиями:
Гипоаскорбемия:
- Недостаток витамина С (цинга) может быть связан с дисфункцией SVCT1, хотя прямые мутации в SLC23A1 редко описаны.(https://www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?gene=SLC23A1)
Агрессивный пародонтит:
- Полиморфизм rs6596473 в гене SLC23A1 ассоциирован с повышенным риском агрессивного пародонтита, что указывает на роль витамина С в патогенезе воспалительных заболеваний десен.(https://www.genscript.com/gene/homo-sapiens/9963/SLC23A1.html)
Преждевременные роды:
- Генетические вариации в SLC23A1 связаны с повышенным риском спонтанных преждевременных родов. (https://www.sciencedirect.com/topics/biochemistry-genetics-and-molecular-biology/slc23a1)
- SNP в интроне 2 гена SLC23A2 (rs6139591) увеличивает риск в 1.7 раза у гетерозигот и в 2.7 раза у гомозигот, но вариации в SLC23A1 также имеют значение.
Раковые заболевания:
- SNPs в SLC23A1 влияют на риск развития лимфомы.(https://www.sciencedirect.com/topics/biochemistry-genetics-and-molecular-biology/slc23a1)
Глазные патологии:
- Полиморфизмы в SLC23A1 связаны с концентрацией аскорбата в водянистой влаге и ядре хрусталика, что может влиять на риск катаракты в условиях дефицита витамина С.(https://www.genscript.com/gene/homo-sapiens/9963/SLC23A1.html)
Кардиометаболические исходы:
- SNP rs33972313 в SLC23A1 ассоциирован с повышением уровня циркулирующей аскорбиновой кислоты, но не влияет на кардиометаболические или сердечно-сосудистые исходы, согласно мета-анализу.(https://www.genscript.com/gene/homo-sapiens/9963/SLC23A1.html)
Нейродегенеративные заболевания:
- Дисфункция SLC23A1 может быть связана с нейродегенеративными заболеваниями, такими как болезнь Альцгеймера или Паркинсона, из-за роли витамина С в защите нейронов от окислительного стресса.(https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/11214969/)
5. Исследования и материалы, связанные с SLC23A1
Ниже приведены ключевые исследования и ресурсы, посвященные гену SLC23A1:
Основные исследования
1. Sotiriou et al., 2002 (Nat Med):
- Исследование показало, что транспортер аскорбиновой кислоты Slc23a1 критически важен для транспорта витамина С в мозг и выживания в перинатальный период у мышей. (https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/11214969/)
- Гомозиготные мыши с нокаутом Slc23a1 демонстрировали аномальный гомеостаз аскорбата, летаргию и раннюю постнатальную летальность.
- DOI: 10.1038/0502-514
2. Bürzle et al., 2013 (Mol Aspects Med):
- Обзор натрий-зависимых транспортеров аскорбиновой кислоты (SLC23A1 и SLC23A2). (https://www.sciencedirect.com/topics/biochemistry-genetics-and-molecular-biology/slc23a1)
- Описаны их структура, функция и связь с заболеваниями, включая влияние SNPs (например, rs33972313) на концентрацию аскорбата в плазме.
- DOI: 10.1016/j.mam.2012.12.002
3. Senthilkumari et al., 2014 (Exp Eye Res):
- Исследование полиморфизмов SLC23A1 и их влияния на концентрацию аскорбата в водянистой влаге и ядре хрусталика в условиях дефицита витамина С.(https://www.genscript.com/gene/homo-sapiens/9963/SLC23A1.html)
- DOI: 10.1016/j.exer.2014.05.013
4. de Jong et al., 2014 (J Clin Periodontol):
- Полиморфизм rs6596473 в SLC23A1 связан с агрессивным пародонтитом, подчеркивая роль витамина С в воспалительных процессах.(https://www.genscript.com/gene/homo-sapiens/9963/SLC23A1.html)
- DOI: 10.1111/jcpe.12255
5. Subramanian et al., 2017 (Am J Physiol Gastrointest Liver Physiol):
- Исследование молекулярных механизмов дифференциальной экспрессии транспортеров витамина С (Slc23a1 и Slc23a2) вдоль кишечника, включая транскрипционные и эпигенетические механизмы.(https://www.genscript.com/gene/homo-sapiens/9963/SLC23A1.html)
- DOI: 10.1152/ajpgi.00375.2016
Ресурсы для дальнейшего изучения
GeneCards:
- Полная информация о гене SLC23A1, включая функции, белки, связанные заболевания, пути, ортологи и экспрессию.
- URL: (https://www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?gene=SLC23A1)
NCBI Gene:
- Официальная база данных с аннотацией гена SLC23A1, включая последовательности, варианты и ссылки на публикации.
- URL: (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene?Db=gene&Cmd=DetailsSearch&Term=9963)
UniProt:
- Информация о белке SVCT1, включая его структуру, функцию и аминокислотную последовательность.
- URL: (https://www.uniprot.org/uniprotkb/Q9UHI7/entry)
GTEx Portal:
- Данные об экспрессии SLC23A1 в различных тканях человека.
- URL: (https://www.gtexportal.org/home/gene/SLC23A1)
Ensembl:
- Геномная информация, включая транскрипты, ортологи и фенотипы, связанные с SLC23A1.
- URL: (http://www.ensembl.org/Mus_musculus/Gene/Summary?g=ENSMUSG00000024354&r=18%253A35614604-35627227&t=ENSMUST00000025212)
Инструменты и продукты для исследований
CRISPR и RNAi:
- (https://www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?gene=SLC23A1) Коммерческие продукты для нокаута или нокдауна SLC23A1 доступны от компаний, таких как Applied Biological Materials, Synthego, VectorBuilder и Santa Cruz Biotechnology.
Антитела:
- (https://www.abbexa.com/slc23a1-antibody) Антитела против SLC23A1 для вестерн-блоттинга, ИФА и иммуногистохимии доступны от Abbexa, Boster Bio и других поставщиков.
Клоны cDNA:
- GenScript предлагает (https://www.genscript.com/gene/homo-sapiens/9963/SLC23A1.html) клоны cDNA SLC23A1 для исследований экспрессии.
6. Перспективы и будущие исследования
Генетические вариации:
- Дальнейшие исследования полиморфизмов SLC23A1 могут уточнить их роль в индивидуальной чувствительности к дефициту витамина С и связанных заболеваниях, таких как рак, нейродегенеративные расстройства и воспалительные процессы.
Терапевтические мишени:
- Понимание структуры и функции SVCT1 может привести к разработке новых подходов для модуляции транспорта витамина С, что важно для лечения состояний, связанных с окислительным стрессом.
Эпигенетическая регуляция:
- Исследования эпигенетических механизмов, регулирующих экспрессию SLC23A1, могут открыть новые пути для персонализированной медицины.
Заключение
Ген SLC23A1 - Кодирует ключевой транспортер витамина С (SVCT1), который обеспечивает его всасывание и гомеостаз в организме.
Дисфункция гена SLC23A1 или генетические вариации связаны с рядом заболеваний, включая пародонтит, преждевременные роды и потенциально нейродегенеративные расстройства.
Исследования SLC23A1 продолжают раскрывать его молекулярные механизмы и клиническое значение, а доступные ресурсы и инструменты облегчают дальнейшее изучение этого гена.