Ген SLC25A11

Ген SLC25A11 (mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier) - Кодирует белок, участвующий в митохондриальном транспорте, особенно в обмене 2-оксоглутарата и малата.

Кажется вероятным, что мутации в данном гене связаны с парганглиомами и феохромоцитомами, хотя точные механизмы требуют дальнейших исследований.

Доказательства указывают на его важную роль в метаболизме, включая глюконеогенез и апоптоз, с высокой экспрессией в сердце и других тканях.

1. Описание гена SLC25A11

Ген SLC25A11, расположенный на хромосоме 17 (позиция 17p13.2), кодирует митохондриальный 2-оксоглутарат/малатный переносчик (OGC).
Данный белок обеспечивает транспорт 2-оксоглутарата через внутреннюю мембрану митохондрий в обмен на малат, что критично для процессов, включая малат-аспартатный шаттл, глюконеогенез и метаболизм азота.
Исследования также связывают его с поддержанием структуры митохондрий и регуляцией апоптоза.

2. Ассоциированные заболевания

Исследования предполагают, что мутации в SLC25A11 могут быть связаны с синдромом парганглиома/феохромоцитома 6 (PPGL6), особенно с метастатическими формами.
Также есть данные о его потенциальной роли в прогнозировании рака печени, но это требует дальнейшего изучения.

3. Исследовательские материалы

Для получения подробной информации посетите GeneCards SLC25A11 или NCBI Gene SLC25A11.
Ключевые публикации доступны через PubMed, включая по ID 29431636 для исследований парганглиом.

4. Подробное описание гена SLC25A11 и связанные исследования

Ген SLC25A11 (Solute Carrier Family 25 Member 11) является протеин-кодирующим геном, играющим ключевую роль в митохондриальной транспортной системе.
Ниже представлено детальное описание его функций, характеристик, связанных заболеваний и обзор доступных исследовательских материалов, основанный на анализе различных научных баз данных и публикаций, актуальных на 29 апреля 2025 года.

5. Функциональное описание

SLC25A11 кодирует митохондриальный 2-оксоглутарат/малатный переносчик (OGC), белок, состоящий из 314 аминокислот с молекулярной массой 34 062 Да (UniProtKB/Swiss-Prot: Q02978).
Данный переносчик катализирует электронейтральный обмен 2-оксоглутарата (альфа-оксоглутарата) через внутреннюю митохондриальную мембрану на малат, а также может обменивать малонат, сукцинат, малеат и оксалоацетат (с меньшим сродством).

Функции включают:

Участие в малат-аспартатном шаттле, обеспечивающем перенос электронов от цитозольного NADH в митохондрии.
Поддержку оксоглутарат-изоцитратного шаттла, важного для метаболического обмена между цитозолем и митохондриями.
Способствование глюконеогенезу, особенно из лактата, и метаболизму азота.
Регуляцию митохондриального слияния/деления, организации крист и апоптоза.
Модуляцию уровней глутатиона в митохондриях, защищая клетки от цитотоксического апоптоза (PubMed: 21448454).
Белок взаимодействует с SMIM26, что может иметь значение для антиметастатической активности, как показано в исследованиях рака почек (PubMed: 37009826).

6. Геномная и экспрессионная информация

Локализация:

Хромосома 17, позиция 4,937,130-4,940,053 (GRCh38/hg38), ориентация минус-странд, размер 2 924 базы.
Предыдущие сборки: GRCh37/hg19 (4,840,425-4,843,341, размер 2 917 баз).

Семьи генов:

Входит в семейство митохондриальных переносчиков (TC 2.A.29), классифицируется как потенциальная мишень для лекарств, мембранный белок и транспортер (The Human Protein Atlas).

Экспрессия:

Наиболее высока в сердце, также выражена в нервной системе, печени, мышцах, легких, почках, надпочечниках, крови, поджелудочной железе, лимфоузлах, коже и щитовидной железе.
Данные доступны на GTEx Portal, BioGPS, Bgee.

7. Ассоциированные заболевания и клинические варианты

Исследования указывают на связь SLC25A11 с несколькими заболеваниями.

Парганглиома/феохромоцитома синдром 6 (PPGL6, MIM: 618464):

Мутации, такие как rs1567650859 (c.715C>A, p.Pro239Thr), связаны с предрасположенностью к метастатическим парганглиомам (PubMed: 29431636).

Рак печени:

SLC25A11 рассматривается как прогностический биомаркер, регулируя уровни глутатиона и производство ROS, что важно для энергетического обмена в опухолях (PMC7303164).

Клинические варианты (ClinVar) включают 5 патогенных/вероятно патогенных вариантов, таких как rs1203876038 (c.439A>G, p.Met147Val) и rs1374026152 (c.107_108del, p.Thr36fs).
Подробности доступны на ClinVar.

8. Молекулярные и клеточные функции (Gene Ontology)

Молекулярная функция:

Включает связывание РНК (GO:0003723), связывание белков (GO:0005515), транспорт сульфата и тиосульфата (GO:0015116, GO:0015117), транспорт оксалоацетата (GO:0015131).

Клеточная компонента:

Нахождение в ядре (GO:0005634), митохондриях (GO:0005739), внутренней митохондриальной мембране (GO:0005743), плазматической мембране (GO:0005886).

Биологические процессы:

Глюконеогенез (GO:0006094), транспорт липидов (GO:0006869), транспорт тиосульфата (GO:0015709).

9. Ортологи и эволюционная сохранность

SLC25A11 имеет ортологи у 184 видов, включая шимпанзе (99,68% сходства), корову (92,25%), собаку (91,61%), мышь (91,61%), крысу (91,61%), зебрафиш (91,61%).
Подробности на Ensembl.

10. Ключевые пути

Транспорт неорганических катионов/анионов и аминокислот/олигопептидов.
Дыхательный электронный транспорт.
Подробности на PathCards, PathCards.

11. Исследовательские материалы и публикации

Для получения всех связанных материалов рекомендуется использовать следующие ресурсы:

GeneCards:

Предоставляет полное описание, включая функции, белки, заболевания, пути, ортологи и экспрессию.
URL: GeneCards SLC25A11.

NCBI Gene:

Детальная информация, включая аннотации GO, взаимодействия с HIV-1, экспрессию.
URL: NCBI Gene SLC25A11.

Harmonizome:

Функциональные ассоциации с биологическими сущностями.
URL: Harmonizome SLC25A11.

Mouse Genome Informatics (MGI):

Информация о мышином ортологе Slc25a11.
URL: MGI Slc25a11.

Rat Genome Database (RGD):

Информация о крысином ортологе Slc25a11.
URL: RGD Slc25a11.

12. Таблица ключевых публикаций

Ниже представлена таблица с ключевыми публикациями, связанными с SLC25A11, включая PubMed ID и краткое описание:

PubMed ID	Заголовок (перевод)	Описание
29431636	Генные мутации SLC25A11 и предрасположенность к парганглиомам	Исследует связь мутаций с метастатическими парганглиомами.
1457818	Последовательности гена 2-оксоглутаратного переносчика	Описывает последовательности человеческого и бычьего генов.
37009826	Антиметастатическая активность микропротеина SMIM26	Упоминает взаимодействие SLC25A11 с SMIM26 в раке почек.
21448454	Связь митохондриального метаболизма, апоптоза и инсулина	Исследует роль SLC25A11 в метаболизме и апоптозе.
10072597	Локализация гена оксоглутаратного переносчика на хромосоме 17	Описывает цитогенетическую локализацию.
16920706	Накопление порфиринов в митохондриях через переносчик	Исследует роль SLC25A11 в накоплении порфиринов.
8597574	Димерная структура митохондриального переносчика	Описывает димерную структуру белка.
15489334	Проект MGC: коллекция млекопитающих cDNA	Включает SLC25A11 в проект по полным cDNA.

13. Обзорные статьи и дополнительные ресурсы

Обзорная статья "The SLC25 Carrier Family: Important Transport Proteins in Mitochondrial Physiology and Pathology" (PMC7611780) охватывает роль SLC25A11 в митохондриальной физиологии, включая его участие в шаттлах и связь с парганглиомами.
Исследование "SLC25A11 serves as a novel prognostic biomarker in liver cancer" (PMC7303164) подчеркивает его роль в раке печени.

Заключение

Ген SLC25A11 является важным элементом митохондриального метаболизма, с потенциальными клиническими приложениями в онкологии и генетических заболеваниях.

Для получения полного списка публикаций и материалов рекомендуется использовать PubMed с запросом "SLC25A11" и указанные выше базы данных.

Ключевые цитирования