Ген SLC25A1
Ген SLC25A1 (Solute Carrier Family 25 Member 1) - Кодирует белок, принадлежащий к семейству митохондриальных переносчиков (SLC25).
Ген SLC25A1 также известен как митохондриальный цитратный транспортер (Citrate Transport Protein, CTP) или цитрат-изоцитратный носитель (CIC).
Митохондриальный цитратный транспортер (Citrate Transport Protein, CTP) играет ключевую роль в транспорте метаболитов через внутреннюю мембрану митохондрий.
Ген SLC25A1 расположен на 22-й хромосоме человека (локус 22q11.21) и высоко консервативен у различных видов, включая рыб, дрожжи и грибы (https://medlineplus.gov/genetics/gene/slc25a1/)(https://www.sinobiological.com/resource/slc25a1/cdna-clones)(https://www.orpha.net/en/disease/gene/SLC25A1).
1. Функция гена SLC25A1
- Ген SLC25A1 кодирует белок, который осуществляет транспорт цитрата из митохондрий в цитозоль в обмен на малат, поступающий в митохондрии (https://medlineplus.gov/genetics/gene/slc25a1/).
- Белок SLC25A1 локализован во внутренней мембране митохондрий и функционирует как антипортер, обеспечивая обмен цитрата на малат, изоцитрат или другие дикарбоновые кислоты (https://rgd.mcw.edu/rgdweb/report/gene/main.html?id=3703).
Этот процесс имеет ключевое значение для:
Энергетического метаболизма:
- Цитрат и малат участвуют в реакциях цикла трикарбоновых кислот (цикла Кребса), который обеспечивает производство энергии в клетке.
- Цитрат, транспортируемый в цитозоль, используется для синтеза жирных кислот и стеролов, а также для регуляции гликолиза (https://medlineplus.gov/genetics/gene/slc25a1/).
Синтеза липидов:
- Цитрат в цитозоле служит субстратом для синтеза ацетил-КоА, который необходим для биосинтеза жирных кислот и холестерина, что особенно важно в тканях, активно синтезирующих липиды, таких как печень и жировая ткань (https://www.mdpi.com/2218-273X/11/2/141).
Эпигенетической регуляции:
- Ацетил-КоА, производимый из цитрата, участвует в ацетилировании гистонов, влияя на экспрессию генов (https://www.mdpi.com/2218-273X/11/2/141).
Регуляции метаболизма:
- Цитрат действует как аллостерический регулятор ферментов, таких как фосфофруктокиназа-1, влияя на гликолиз и глюконеогенез.
2. Структура гена и белка
Ген:
- SLC25A1 состоит из нескольких экзонов и интронов, его последовательность была впервые описана в 1997 году (Iacobazzi et al.) (https://medlineplus.gov/genetics/gene/slc25a1/).
- Ген содержит альтернативные сплайсинговые варианты, что приводит к образованию различных
Белок:
- Белок SLC25A1 (также называемый CIC) состоит из примерно 311 аминокислот и имеет шесть трансмембранных доменов, характерных для семейства митохондриальных переносчиков.
- Молекулярная масса белка SLC25A1составляет около 34 кДа.
- Белок высоко экспрессируется в тканях с активным метаболизмом, таких как печень, почки, поджелудочная железа, мозг и жировая ткань (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/IEB/Research/Acembly/av.cgi?db=mouse&c=gene&a=fiche&l=Slc25a1)(https://www.antibodypedia.com/gene/22859/SLC25A1).
Псевдогены:
- Псевдогены SLC25A1 обнаружены на хромосомах 7, 11, 16 и 19, что может усложнять генетический анализ (https://www.sinobiological.com/resource/slc25a1/cdna-clones)(https://www.antibodypedia.com/gene/22859/SLC25A1).
3. Связанные заболевания
- Мутации в гене SLC25A1 ассоциированы с несколькими редкими генетическими заболеваниями, а также с онкологическими и метаболическими нарушениями.
3.1. Комбинированная D,L-2-гидроксиглутаровая ацидурия (D,L-2-HGA):
Описание:
- Ацидурия это редкое аутосомно-рецессивное заболевание, вызванное мутациями в SLC25A1, приводящими к снижению функции цитратного транспортера (https://medlineplus.gov/genetics/gene/slc25a1/).
- Нарушение транспорта цитрата и малата приводит к накоплению токсичных метаболитов, таких как D-2-гидроксиглутаровая и L-2-гидроксиглутаровая кислоты, в клетках.
Симптомы:
- Тяжелые неврологические нарушения, включая задержку развития, эпилепсию, гипотонию и энцефалопатию.
- Симптомы обычно проявляются в раннем младенчестве.
- Мозг особенно уязвим к токсическому действию этих метаболитов.
Механизм:
- Мутации (их известно не менее 12) значительно снижают активность белка SLC25A1, нарушая энергетический метаболизм и вызывая накопление токсичных соединений.
- Высокие уровни D-2- и L-2-гидроксиглутарата повреждают клетки, особенно нейроны (https://medlineplus.gov/genetics/gene/slc25a1/).
Диагностика:
- Диагностируется с помощью анализа мочи на содержание гидроксиглутаровых кислот и генетического тестирования (https://search.thegencc.org/genes/HGNC:10979).
Источник:
- Nota et al. (2013) впервые описали связь дефицита SLC25A1 с D,L-2-HGA (https://medlineplus.gov/genetics/gene/slc25a1/).
3.2. Врожденный миастенический синдром 23 типа (CMS23):
Описание:
- Аутосомно-рецессивное заболевание, связанное с мутациями в SLC25A1, приводящими к нарушению нервно-мышечной передачи (https://search.thegencc.org/genes/HGNC:10979).
Симптомы:
- Мышечная слабость, утомляемость, проблемы с дыханием и движением (https://www.orpha.net/en/disease/gene/SLC25A1).
Механизм:
- Нарушение транспорта цитрата может влиять на метаболизм нейронов и синаптическую передачу, хотя точные механизмы требуют дальнейшего изучения.
3.3. Онкологические заболевания:
Роль в раке:
- Усиленная экспрессия или амплификация гена SLC25A1 наблюдается в ряде опухолей, включая рак печени, легких и молочной железы, что связано с повышенной потребностью раковых клеток в цитрате для синтеза липидов, необходимых для быстрого роста (https://www.mdpi.com/2218-273X/11/2/141).
- SLC25A1 считается потенциальной мишенью для терапии.
Ингибиторы:
- Разработаны ингибиторы SLC25A1, такие как CTPI-2, которые демонстрируют перспективы в лечении рака и метаболических нарушений.
- CTPI-2 снижает рост опухолей и улучшает метаболические параметры в моделях мышей (https://www.mdpi.com/2218-273X/11/2/141).
3.4. Метаболические и аутоиммунные нарушения:
Метаболический синдром и диабет:
- Исследования показывают, что экспрессия SLC25A1 регулируется уровнем глюкозы в крови.
- Ингибиторы SLC25A1, такие как CTPI-2, могут улучшать чувствительность к инсулину и снижать глюкозную непереносимость, что делает их перспективными для лечения диабета и неалкогольной жировой болезни печени (NAFLD/NASH) (https://www.mdpi.com/2218-273X/11/2/141).
Аутоиммунные заболевания:
- Изменения активности SLC25A1 связаны с ревматоидным артритом и болезнью Бехчета, хотя механизмы остаются не до конца изученными (https://www.mdpi.com/2218-273X/11/2/141).
Синдром Дауна:
- Нарушение функции SLC25A1 может играть роль в метаболических изменениях при синдроме Дауна (https://www.mdpi.com/2218-273X/11/2/141).
4. Ключевые исследования и материалы
- Ниже приведены основные исследования, связанные с геном SLC25A1, с акцентом на его функцию, структуру и клиническое значение.
- Эти работы доступны через PubMed и другие научные базы данных.
4.1. Структурные и функциональные исследования:
Iacobazzi V, Lauria G, Palmieri F. (1997) "Organization and sequence of the human gene for the mitochondrial citrate transport protein."DNA Seq. DOI: 10.3109/10425179709034029.
Описание:
- Первое исследование, описывающее организацию и последовательность гена SLC25A1 у человека.
- Установлена структура гена и его локализация на хромосоме 22 (https://medlineplus.gov/genetics/gene/slc25a1/).
Palmieri F. (2013) "The mitochondrial transporter family SLC25: identification, properties and physiopathology." Mol Aspects Med.
Описание:
- Обзор семейства митохондриальных переносчиков, включая SLC25A1, с акцентом на их роль в физиологии и патологии (https://medlineplus.gov/genetics/gene/slc25a1/).
4.2. Клинические исследования
Nota B, et al. (2013) "Deficiency in SLC25A1, encoding the mitochondrial citrate carrier, causes combined D-2- and L-2-hydroxyglutaric aciduria." Am J Hum Genet. DOI: 10.1016/j.ajhg.2013.03.009.
Описание:
- Ключевое исследование, установившее связь мутаций SLC25A1 с D,L-2-HGA.
- Описаны механизмы накопления токсичных метаболитов и их влияние на мозг (https://medlineplus.gov/genetics/gene/slc25a1/).
Stoffel M, et al. (1996) "The human mitochondrial citrate transporter gene (SLC20A3) maps to chromosome band 22q11." Hum Genet.
Описание:
- Исследование, уточняющее локализацию гена и его связь с регионом, ассоциированным с синдромом ДиДжорджи и шизофренией (https://www.wikigenes.org/e/gene/e/6576.html).
4.3. Онкология и метаболизм
Fernandez HR, et al. (2021) "The mitochondrial citrate carrier SLC25A1/CIC and the fundamental role of citrate in cancer, inflammation and beyond." Biomolecules. DOI: 10.3390/biom11020207.
Описание:
- Обзор роли SLC25A1 в раке, воспалении и метаболических заболеваниях.
- Рассматриваются перспективы ингибиторов SLC25A1, таких как CTPI-2, для терапии (https://www.mdpi.com/2218-273X/11/2/141).
Rauckhorst AJ, et al. (2025) "A hierarchical hepatic de novo lipogenesis substrate supply network utilizing pyruvate, acetate, and ketones." Cell Metab. DOI: 10.1016/j.cmet.2024.12.001.
Описание:
- Исследование, изучающее роль SLC25A1 в липогенезе и метаболизме печени, с акцентом на его взаимодействие с другими метаболическими путями (https://www.informatics.jax.org/marker/MGI:1345283).
4.4. Ингибиторы и терапевтические подходы
Mycielska ME, et al. (2018) "Citrate transport and metabolism in cancer." Front Immunol.
Описание:
- Исследование роли цитратного транспорта в метаболизме раковых клеток и потенциала ингибиторов SLC25A1 (https://www.wikigenes.org/e/gene/e/6576.html).
Catalina-Rodriguez O, et al. (2018) "The mitochondrial citrate transporter, CIC, is essential for hepatic lipogenesis." J Biol Chem.
Описание:
- Демонстрирует критическую роль SLC25A1 в липогенезе печени и его связь с метаболическими заболеваниями (https://www.mdpi.com/2218-273X/11/2/141).
4.5. Генетические базы данных и ресурсы
AceView (NCBI):
- Предоставляет информацию о сплайсинговых вариантах SLC25A1, экспрессии в различных тканях и ортологах в других организмах (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/IEB/Research/Acembly/av.cgi?db=mouse&c=gene&a=fiche&l=Slc25a1).
Human Protein Atlas:
- Данные об экспрессии белка SLC25A1 в различных тканях человека (https://www.proteinatlas.org/ENSG00000100075-SLC25A1).
GenCC:
- Информация о генетических ассоциациях SLC25A1 с заболеваниями, включая D,L-2-HGA и CMS23 (https://search.thegencc.org/genes/HGNC:10979).
Orphanet:
- Ресурс, описывающий редкие заболевания, связанные с SLC25A1, и диагностические подходы (https://www.orpha.net/en/disease/gene/SLC25A1).
Mouse Genome Informatics (MGI):
- Данные о фенотипах мышей с нокаутом Slc25a1, включая метаболические и неврологические нарушения (https://www.informatics.jax.org/marker/MGI:1345283).
5. Экспрессия и регуляция
Тканевая экспрессия:
- SLC25A1 высоко экспрессируется в печени, почках, поджелудочной железе, мозге, жировой ткани и других метаболически активных тканях (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/IEB/Research/Acembly/av.cgi?db=mouse&c=gene&a=fiche&l=Slc25a1)(https://www.antibodypedia.com/gene/22859/SLC25A1).
Регуляция:
- Экспрессия гена регулируется метаболическими сигналами, такими как уровень глюкозы.
- Высокий уровень глюкозы усиливает экспрессию SLC25A1, тогда как низкий уровень глюкозы подавляет её, что делает SLC25A1 потенциальной мишенью для лечения метаболических расстройств (https://www.mdpi.com/2218-273X/11/2/141).
Эпигенетическая регуляция:
- Цитрат, транспортируемый SLC25A1, влияет на ацетилирование гистонов, что может модулировать экспрессию других генов (https://www.mdpi.com/2218-273X/11/2/141).
6. Перспективы исследований
Терапевтические мишени:
- Ингибиторы SLC25A1, такие как CTPI-2, показывают перспективы в лечении рака, метаболического синдрома и диабета.
- Необходимы дальнейшие исследования для оценки их безопасности и эффективности (https://www.mdpi.com/2218-273X/11/2/141).
Модели нокаутов:
- Исследования на мышах с нокаутом Slc25a1 (например, L-CIC-KO) демонстрируют частичное снижение стеатоза печени, но не полное устранение метаболических нарушений, что указывает на компенсаторные механизмы (https://www.mdpi.com/2218-273X/11/2/141).
Генетические исследования:
- Дальнейшее изучение мутаций SLC25A1 и их связи с неврологическими и метаболическими фенотипами может улучшить диагностику и лечение редких заболеваний.
7. Рекомендации по поиску материалов
Для получения дополнительных материалов и исследований по SLC25A1 рекомендуется использовать следующие ресурсы:
PubMed:
- Поиск по ключевым словам "SLC25A1", "mitochondrial citrate transporter", "D,L-2-hydroxyglutaric aciduria" (https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/).
NCBI Gene:
- Подробная информация о гене, включая последовательности, ортологи и экспрессию (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/6576).
UniProt:
- Данные о структуре и функции белка SLC25A1 (https://www.uniprot.org/uniprot/P53007).
Human Protein Atlas:
- Экспрессия белка в тканях (https://www.proteinatlas.org/ENSG00000100075-SLC25A1).
Orphanet:
- Информация о редких заболеваниях, связанных с SLC25A1 (https://www.orpha.net/en/disease/gene/SLC25A1).
GenCC:
- Генетические ассоциации и клинические данные (https://search.thegencc.org/).
Заключение
Ген SLC25A1 - играет центральную роль в митохондриальном транспорте цитрата, влияя на энергетический метаболизм, синтез липидов и эпигенетическую регуляцию.
Мутации в этом гене вызывают тяжелые заболевания, такие как D,L-2-HGA и CMS23, а его гиперэкспрессия связана с онкологическими и метаболическими нарушениями.
Исследования SLC25A1 продолжают раскрывать его значение в патологии и потенциал как терапевтической мишени.
Для дальнейшего изучения рекомендуется обращаться к специализированным базам данных и научным статьям, указанным выше.