Ген SLC26A1
Ген SLC26A1 (Solute Carrier Family 26 Member 1) - Кодирует белок, принадлежащий к семейству транспортеров анионов SLC26, известных как сульфат/анионные транспортеры.
Ген SLC26A1 играет важную роль в поддержании гомеостаза сульфатов и других анионов в организме, а его дисфункция связана с различными патологиями, включая нефролитиаз.
1. Основные характеристики гена SLC26A1
Локализация:
- Ген SLC26A1 расположен на хромосоме 4 человека (4p16.3).
- Молекулярное местоположение гена SLC26A1: базовые пары от 979,073 до 993,404 (по данным NCBI, GRCh38.p13) (GHR).
Структура:
- Ген SLC26A1 состоит из 4 экзонов и кодирует белок, известный как SAT1 (Sulfate Anion Transporter 1).
- Были идентифицированы три сплайс-варианта гена SLC26A1, кодирующие различные изоформы белка (GTR, GeneCards).
Семейство:
- Ген SLC26A1 принадлежит к семейству SLC26, которое включает 10 функциональных членов (SLC26A1–A11, за исключением SLC26A10, который является псевдогеном).
- Семейство SLC26 характеризуется высокой консервативностью геномной структуры, включая число и размер экзонов, и белковой структуры, включая длину аминокислотной последовательности, но различается по тканевой экспрессии (Labome, PubMed).
Функция белка:
- Белок SAT1 представляет собой натрий-независимый транспортер анионов, который обеспечивает обмен сульфатов, бикарбонатов, тиосульфатов и оксалатов через клеточные мембраны.
- Белок SAT1 выполняет функции вторичного активного транспортера сульфатов и устаревшего анион-анионного антипортера (GeneCards).
2. Экспрессия и локализация
Тканевая экспрессия:
- Ген SLC26A1 преимущественно экспрессируется в печени, поджелудочной железе и головном мозге.
- Ген SLC26A1 также обнаружен в почках, кишечнике и эмалевых клетках зубов (амелобластах) (GTR, GeneCards, PMC).
Клеточная локализация:
- Белок SAT1 локализуется в базолатеральной плазматической мембране клеток, включая почки и печень, и в апикальной мембране в некоторых тканях, включая амелобласты.
- В амелобластах белок SAT1, наряду с SLC26A6 и SLC26A7, обнаруживается в апикальной области цитоплазматической мембраны, а SLC26A7 также присутствует в цитоплазматической/субапикальной области, предположительно на лизосомальной мембране (RGD, PMC).
3. Функции белка SAT1
- Белок SAT1 обеспечивает обмен сульфатов с другими анионами, включая бикарбонат, оксалат и тиосульфат, участвуя в сульфат-оксалатном, сульфат-бикарбонатном и сульфат-тиосульфатном обмене (GeneCards).
- Ген SLC26A1 является ключевым регулятором сульфатного обмена в организме, особенно в почках и печени, что важно для метаболизма и детоксикации (GTR).
- В амелобластах белок SAT1, наряду с SLC26A6 и SLC26A7, участвует в транспорте бикарбоната, необходимого для поддержания pH во время созревания эмали, взаимодействуя с CFTR, образуя функциональные комплексы (PMC).
- Белок SAT1 играет роль в транспорте оксалатов, что связывает его с образованием кальций-оксалатных почечных камней (PMC).
4. Связанные заболевания
Кальций-оксалатный нефролитиаз (MIM#167030):
- Генетическая дисфункция гена SLC26A1 связана с гипероксалурией и образованием кальций-оксалатных почечных камней.
- В исследованиях на мышах с нокаутом Slc26a1 наблюдались гипероксалурия, нефрокальциноз и камни в почечных канальцах и мочевом пузыре (MGI, Genomics England).
- В когорте из 13 пациентов с рецидивирующим кальций-оксалатным нефролитиазом были обнаружены миссенс-мутации, включая M132T, R372H и Q556R (PMC, PubMed).
- Мутация M132T, гетерозиготная, обнаружена у пациента с тяжелым нефрокальцинозом, потребовавшим нефрэктомии, затрагивает высококонсервативный остаток в третьем трансмембранном домене белка SAT1, что может нарушать его функцию.
- Мутация R372H, гетерозиготная, выявлена у одного пациента.
- Мутация Q556R, наиболее частая, обнаружена у нескольких пациентов (гетерозиготная и гомозиготная), но высокая частота аллеля Q556R (0.3484 в NCBI) и отсутствие доказательств значительного функционального нарушения ставят под сомнение ее патогенность.
- Некоторые исследования, включая работу Whittamore et al., не подтвердили гипероксалурию в моделях мышей с нокаутом Slc26a1, что указывает на необходимость дальнейших исследований (Genomics England).
Гиперсульфатурия:
- Ген SLC26A1 является основным регулятором гомеостаза сульфатов в организме.
- Дисфункция гена SLC26A1 может приводить к повышенному выведению сульфатов с мочой, что потенциально связано с нефролитиазом (GTR).
Роль в эмалевом развитии:
- Мутации гена SLC26A1 не связаны с заболеваниями человека в области эмалевого развития.
- Исследования на мышах показали, что Slc26a1 участвует в регуляции pH во время созревания эмали.
- Отсутствие Slc26a1 у мышей приводит к компенсаторной гиперэкспрессии других генов, включая Cftr, Slc4a4, Slc4a9 и Slc26a9, что предотвращает явные аномалии эмали (PMC).
5. Исследования и материалы, связанные с SLC26A1
Human SLC26A1 Gene Variants (Dawson et al., 2013):
- Цель исследования: Изучение роли гена SLC26A1 в рецидивирующем кальций-оксалатном нефролитиазе у людей.
- Методы: Секвенирование гена SLC26A1 у 13 пациентов с рецидивирующими почечными камнями.
- Результаты: Обнаружены три миссенс-мутации (M132T, R372H, Q556R).
- Мутация M132T, затрагивающая консервативный остаток, считается наиболее значимой.
- Высокая частота Q556R предполагает, что она может быть нейтральной.
- Выводы: Необходимы более масштабные исследования для подтверждения патогенности мутаций гена SLC26A1 (PMC, PubMed).
Mutations in SLC26A1 Cause Nephrolithiasis (Gee et al., 2016):
- Цель исследования: Подтверждение роли гена SLC26A1 в нефролитиазе.
- Результаты: Идентифицированы бяллельные мутации у двух пациентов и моноаллельные у трех пациентов.
- Высокая частота аллеля Q556R и отсутствие функциональных нарушений для некоторых вариантов, включая A56T и M132T, ставят под сомнение их роль.
- Выводы: Ген SLC26A1 классифицируется как ген с «умеренной» (amber) значимостью для нефролитиаза до получения дополнительных доказательств (PubMed).
SLC26A Gene Family Participate in pH Regulation during Enamel Maturation (Yin et al., 2015):
- Цель исследования: Изучение роли Slc26a1, Slc26a6 и Slc26a7 в регуляции pH во время созревания эмали.
- Методы: Анализ экспрессии генов (qPCR, Western blot), иммуногистохимия, исследование мышей с нокаутом Slc26a1 и Slc26a7.
- Результаты: Slc26a1 высоко экспрессируется в амелобластах на стадии созревания, локализуется в апикальной мембране и взаимодействует с CFTR.
- У нокаутных мышей не наблюдалось явных аномалий эмали, но отмечалась компенсаторная гиперэкспрессия других ионных транспортеров.
- Выводы: Slc26a1 участвует в транспорте бикарбоната, необходимого для pH-гомеостаза в амелобластах (PMC, ResearchGate).
Characterization of the Human Sulfate Anion Transporter (hsat-1) Protein and Gene (Regeer et al., 2003):
- Цель исследования: Характеристика структуры и функции человеческого белка SAT1.
- Результаты: Подтверждена роль белка SAT1 как натрий-независимого транспортера сульфатов и оксалатов.
- Описана геномная организация гена SLC26A1.
- Выводы: Ген SLC26A1 играет ключевую роль в сульфатном гомеостазе (GTR).
Slc13a1 and Slc26a1 KO Models Reveal Physiological Roles of Anion Transporters (Markovich, 2012):
- Цель исследования: Обзор физиологических ролей Slc26a1 в моделях нокаутных мышей.
- Результаты: Нокаут Slc26a1 у мышей приводит к гипероксалурии и нефролитиазу, а также к повышенной чувствительности к ацетаминофен-индуцированному повреждению печени.
- Выводы: Slc26a1 критически важен для оксалатного и сульфатного обмена (PubMed).
SLC26A1 is a Major Determinant of Sulfate Homeostasis in Humans (Pfau et al., 2023):
- Цель исследования: Исследование роли гена SLC26A1 в сульфатном гомеостазе у людей.
- Результаты: Подтверждена ключевая роль гена SLC26A1 в регуляции уровня сульфатов в моче и плазме.
- Мутации гена SLC26A1 связаны с гиперсульфатурией, но не всегда с гипероксалурией.
- Выводы: Ген SLC26A1 является важным регулятором сульфатного обмена, но его роль в оксалатном метаболизме требует уточнения (GTR).
6. Противоречия и ограничения исследований
- Высокая частота варианта Q556R и отсутствие воспроизводимости гипероксалурии в некоторых моделях мышей, включая работу Whittamore et al., ставят под сомнение прямую причинно-следственную связь гена SLC26A1 с нефролитиазом (Genomics England).
- В моделях нокаутных мышей отсутствие фенотипических изменений, включая эмалевое развитие, может быть связано с компенсаторной экспрессией других транспортеров, таких как Slc26a9 и Cftr (PMC).
- Большинство исследований гена SLC26A1 проводилось на небольших когортах, что требует более масштабных популяционных исследований для подтверждения патогенности вариантов (PMC).
7. Перспективы исследований
- Необходимы более масштабные генетические исследования для подтверждения роли мутаций гена SLC26A1 в нефролитиазе и гиперсульфатурии.
- Анализ редких вариантов, включая M132T, может выявить их функциональное значение.
- Изучение взаимодействий белка SAT1 с другими белками, включая CFTR, и их роли в pH-гомеостазе может раскрыть новые терапевтические мишени.
- Уточнение фенотипов нокаутных моделей и изучение компенсаторных механизмов помогут лучше понять физиологическую роль гена SLC26A1.
- Разработка генетических тестов для выявления мутаций гена SLC26A1 у пациентов с рецидивирующим нефролитиазом может улучшить диагностику и лечение.
8. Ресурсы для дальнейшего изучения
Базы данных:
- NCBI Gene - Информация о гене SLC26A1.
- GeneCards - Полная информация о гене SLC26A1.
- UniProt - Аннотации белка SAT1.
- Human Protein Atlas - Данные об экспрессии гена SLC26A1.
Публикации:
- PubMed -Поиск по ключевым словам «SLC26A1», «SAT1», «nephrolithiasis», «sulfate transporter», включая PMID: 24250268, 27210743, 36719378 (PubMed).
- ResearchGate - Доступ к статьям, включая Dawson et al. (2013) и Yin et al. (2015).
Клинические ресурсы:
- NIH Genetic Testing Registry - Информация о гене SLC26A1.
- Genomics England PanelApp - Данные о клинической значимости гена SLC26A1.
Заключение
Ген SLC26A1 кодирует белок SAT1, который играет ключевую роль в транспорте анионов, включая сульфаты, оксалаты и бикарбонаты, и поддержании сульфатного и pH-гомеостаза.
Дисфункция гена SLC26A1 связана с кальций-оксалатным нефролитиазом и гиперсульфатурией, хотя патогенность некоторых мутаций, включая Q556R, остается под вопросом.
Ген SLC26A1 также участвует в регуляции pH во время созревания эмали, взаимодействуя с CFTR.