Ген SLC27A1
Ген SLC27A1 (Solute Carrier Family 27 Member 1) - Кодирует белок, известный как FATP1, играющий ключевую роль в транспорте и метаболизме длинноцепочечных и очень длинноцепочечных жирных кислот.
Белок SLC27A1 важен для липидного обмена в различных тканях, включая яичники и жировую ткань.
1. Подробное описание гена SLC27A1
- Ген SLC27A1, также известный как FATP1, ACSVL5 и FATP-1, расположен на хромосоме 19p13.11 и состоит из 16 экзонов (NCBI Gene).
- Геномные координаты гена SLC27A1 - GRCh38.p14, NC_000019.10 (17468767..17506168).
- Белок SLC27A1 обеспечивает транспорт длинноцепочечных жирных кислот (LCFA) через плазматическую мембрану.
- Белок SLC27A1 активирует жирные кислоты, образуя ацил-КоА, что предотвращает их выход из клеток.
- Ген SLC27A1 участвует в сигнальных путях PPAR, p53 и MAPK, связанных с метаболизмом липидов и холестерина.
- Экспрессия гена SLC27A1 убиквитарная, с наивысшими уровнями в яичниках (RPKM 10.2) и жировой ткани (RPKM 9.1).
- Исследования связывают ген SLC27A1 с синдромом ихтиоза преждевременности и дефицитом гликопротеина IV тромбоцитов, но эти связи требуют подтверждения.
| Категория | Детали |
|---|---|
| Официальный символ | SLC27A1 |
| Локация | Хромосома 19p13.11, 16 экзонов |
| Экспрессия | Высока в яичниках и жировой ткани |
| Основные функции | Транспорт LCFA, активация жирных кислот, метаболизм липидов |
| Ассоциированные заболевания | Синдром ихтиоза преждевременности, дефицит гликопротеина IV тромбоцитов |
| Связанные пути | PPAR, p53, MAPK сигнальные пути |
2. Связанные исследования
Структура и экспрессия гена:
- Исследование «The human fatty acid transport protein-1 (SLC27A1; FATP-1) cDNA and gene» описывает структуру гена SLC27A1, состоящего из 12 экзонов, и его локализацию на хромосоме 19p13.1 (PubMed).
- Высокая экспрессия мРНК гена SLC27A1 обнаружена в мышцах и жировой ткани, с минимальной экспрессией в печени.
Роль в регуляции вкуса мяса у кур:
- Статья «The SLC27A1 Gene and Its Enriched PPAR Pathway» показывает, что ген SLC27A1 регулирует содержание гексанала, влияющего на вкус мяса кур (PubMed).
- Методы RNA-seq и WGCNA выявили 651 дифференциально экспрессированный ген, включая SLC27A1, обогащенных в путях PPAR, p53 и MAPK.
Влияние на отложение внутримышечного жира:
- Исследование «Lower Expression of SLC27A1 Enhances Intramuscular Fat Deposition» демонстрирует, что снижение экспрессии гена SLC27A1 увеличивает внутримышечный жир у кур за счет подавления окисления жирных кислот, опосредованного CPT1A (PubMed).
- Эксперименты в клетках QM-7 подтвердили роль гена SLC27A1 в регуляции триглицеридов.
Возрастные и тканеспецифические изменения экспрессии:
- Работа «Age-related expression profile of the SLC27A1 gene» изучала возрастные изменения экспрессии гена SLC27A1 в тканях кур, включая сердце, мышцы, печень и брюшной жир (PubMed).
- Экспрессия гена SLC27A1 варьировалась в зависимости от возраста (0-12 недель).
Сравнительные исследования у других видов:
- Исследование «Structural and functional characterization of the bovine SLC27A1» описывает структуру гена SLC27A1 у крупного рогатого скота, состоящего из 13 экзонов, с высокой экспрессией в сердце и мышцах (PubMed).
- Низкая экспрессия гена SLC27A1 обнаружена в печени коров, что подчеркивает эволюционную консервативность.
Потенциальная роль в иммунологии и онкологии:
- Статья «SLC27A2 is a potential immune biomarker» упоминает связь гена SLC27A1 с иммунными механизмами в гематологических опухолях, хотя акцент сделан на SLC27A2 (BMC Medical Genomics).
3. Обсуждение
- Ген SLC27A1 играет центральную роль в транспорте и метаболизме жирных кислот, влияя на отложение внутримышечного жира и вкус мяса.
- Экспрессия гена SLC27A1 варьируется в зависимости от возраста и тканей, что важно для исследований в питании и сельском хозяйстве.
- Связь гена SLC27A1 с заболеваниями, такими как синдром ихтиоза преждевременности, требует дальнейших исследований.
- Потенциальная роль гена SLC27A1 в иммунологии и онкологии открывает новые направления для исследований.
| Исследование | Тема | Ключевые результаты |
|---|---|---|
| The human fatty acid transport protein-1 (SLC27A1) | Структура и экспрессия | 12 экзонов, высокая экспрессия в мышцах и жировой ткани |
| The SLC27A1 Gene and Its Enriched PPAR Pathway | Регуляция гексанала в мясе кур | Связан с путями PPAR, p53, MAPK, влияет на вкус мяса |
| Lower Expression of SLC27A1 Enhances IMF Deposition | Отложение внутримышечного жира у кур | Снижение экспрессии увеличивает IMF за счет подавления окисления |
| Age-related expression profile of SLC27A1 | Возрастные изменения экспрессии | Вариации в сердце, мышцах, печени и жире в зависимости от возраста |
| Structural and functional characterization (bovine) | Сравнительный анализ у коров | Высокая экспрессия в сердце, мышцах, низкая в печени |
4. Ресурсы для дальнейшего изучения
Базы данных:
- NCBI Gene - Подробная информация о гене SLC27A1.
- GeneCards - Данные о структуре и функциях гена SLC27A1.
- Ensembl - Геномные данные гена SLC27A1.
Журналы и публикации:
- PubMed, 2000 - Структура и экспрессия гена SLC27A1 у человека.
- PubMed, 2022 - Роль гена SLC27A1 в регуляции вкуса мяса кур.
- PubMed, 2017 - Влияние гена SLC27A1 на отложение внутримышечного жира.
- PubMed, 2011 - Возрастные изменения экспрессии гена SLC27A1 у кур.
- PubMed, 2006 - Структура и функции гена SLC27A1 у коров.
- BMC Medical Genomics, 2024 - Потенциальная роль SLC27A1 в иммунологии и онкологии.
- PubMed - Поиск по ключевому слову “SLC27A1” для актуальных статей (PubMed).
Заключение
Ген SLC27A1 является важным регулятором метаболизма липидов, влияя на транспорт и метаболизм жирных кислот.
Ген SLC27A1 имеет потенциальное значение для качества мяса, метаболизма жиров и возможной связи с заболеваниями, такими как синдром ихтиоза преждевременности.
Дальнейшие исследования необходимы для полного понимания роли гена SLC27A1 в здоровье человека и сельском хозяйстве.