+7 (953) 870-47-02
Отправить письмо
С 9:00 до 21:00 Без выходных

  • Ваша корзина пуста!

  • Ген SLC27A4

Ген SLC27A4

Ген SLC27A4

Ген SLC27A4 (Solute Carrier Family 27 Member 4) - Кодирует белок FATP4, участвующий в транспорте и метаболизме длинноцепочечных жирных кислот.

Белок SLC27A4 играет ключевую роль в поглощении жирных кислот, особенно в тонкой кишке, и связан с редким заболеванием - синдромом ихтиоза преждевременности.


1. Генетическая и молекулярная информация

  • Ген SLC27A4 расположен на хромосоме 9q34.11, с геномными координатами chr9:128,340,527-128,361,470 (GRCh38) (GeneCards).
  • Ген SLC27A4 состоит из 12 или 13 экзонов, охватывающих более 17 килобаз.
  • Белок SLC27A4 кодирует белок длиной 643 аминокислоты с молекулярной массой 72,064 Да.
  • Белок SLC27A4 включает N-терминальный трансмембранный участок, сигнал локализации в эндоплазматическом ретикулуме и мотивы связывания AMP и ATP/AMP.


2. Функции и экспрессия

  • Белок SLC27A4 участвует в транслокации длинноцепочечных жирных кислот через плазматическую мембрану (GeneCards).
  • Белок SLC27A4 обладает активностью ацил-КоА-лигазы, катализируя образование ацил-КоА из длинноцепочечных и очень длинноцепочечных жирных кислот.
  • Ген SLC27A4 играет ключевую роль в формировании эпидермального барьера и всасывании жиров в эмбриональном развитии.
  • Ген SLC27A4 косвенно подавляет активность RPE65, предотвращая дегенерацию сетчатки.
  • Высокая экспрессия гена SLC27A4 наблюдается в мозге, семенниках, колоне, почках и жировой ткани.
  • В тонкой кишке ген SLC27A4 высоко экспрессирован на апикальной стороне энтероцитов, являясь основным транспортером жирных кислот.


3. Связанные заболевания

  • Мутации в гене SLC27A4 вызывают синдром ихтиоза преждевременности (IPS), характеризующийся преждевременными родами, чешуйчатой кожей и дыхательными осложнениями (OMIM).
  • Фибробласты пациентов с IPS показывают сниженную активность ацил-КоА-лигазы и уменьшенное включение VLCFA в липиды.
  • Ген SLC27A4 может быть связан с синдромом инсулинорезистентности, хотя эта связь требует подтверждения.
  • Полиморфизм G209S гена SLC27A4 ассоциирован с более низким индексом массы тела и уровнями инсулина у шведских мужчин.


4. Ключевые мутации и варианты

  • Мутации гена SLC27A4, связанные с IPS, включают C168X (rs137853131) и A92T (rs137853132) в скандинавских семьях (PubMed).
  • Мутация IVS4AS, G-A, -1 (rs1588559786) обнаружена в северноафриканских семьях.
  • Мутация R583H (rs137853135) выявлена в ближневосточных семьях.
  • Мутации C403Y (rs2131266064) и R510H (rs764219842) описаны в японском случае IPS.
  • Мутации c.1322dup (rs746178942) и c.988-19A-G (rs2131265398) найдены у испанских сестер с IPS.
  • Все перечисленные мутации классифицированы как патогенные в базе ClinVar.


5. Животные модели

  • Мышиная модель с мутацией 'wrinkle-free' в гене Slc27a4 демонстрирует фенотип, схожий с IPS, включая плотную кожу и дыхательные трудности (GeneCards).
  • Мутантные мыши умирают вскоре после рождения из-за дефектов кожного барьера и волосяных фолликулов.


6. Обзор исследований

  • Исследование Klar J et al. (2009) описывает мутации гена SLC27A4, вызывающие IPS, и их влияние на метаболизм VLCFA (PubMed).
  • Tsuge I et al. (2015) выявили новые мутации гена SLC27A4 у японского пациента с IPS (PubMed).
  • Esperon-Moldes E et al. (2019) описали гетерозиготные мутации гена SLC27A4 у испанских сестер с IPS (PubMed).
  • Hirsch D et al. (1998) охарактеризовали функцию белка SLC27A4 в кишечнике (PubMed).
  • Stahl A et al. (1999) подтвердили роль белка SLC27A4 как основного транспортера жирных кислот в кишечнике (PubMed).


7. Ключевые мутации и их ассоциации

Мутация rs ID Популяция Ассоциация
C168X rs137853131 Скандинавские IPS
IVS4AS, G-A, -1 rs1588559786 Северноафриканские IPS
A92T rs137853132 Скандинавские IPS
S247P rs137853133 Скандинавские IPS
Q300R rs137853134 Скандинавские IPS
IVS7AS, A-G, -2 rs764922350 Скандинавские IPS
R583H rs137853135 Ближневосточные IPS
C403Y rs2131266064 Японский IPS
R510H rs764219842 Японский IPS
c.1322dup rs746178942 Испанские IPS
c.988-19A-G rs2131265398 Испанские IPS


8. Доступные ресурсы

Базы данных:

  • GeneCards - Информация о функции, белках и экспрессии гена SLC27A4.
  • OMIM - Детальные данные о фенотипических ассоциациях и мутациях гена SLC27A4.
  • HGMD - База данных мутаций гена SLC27A4 с клиническим значением.
  • Rat Genome Database - Данные об ортологе Slc27a4 у крыс.

Журналы и публикации:

  • Am J Hum Genet, 2009 - Мутации гена SLC27A4, вызывающие IPS.
  • Hum Genome Var, 2015 - Новые мутации гена SLC27A4 у японского пациента с IPS.
  • Eur J Med Genet, 2019 - Мутации гена SLC27A4 у испанских сестер с IPS.
  • J Biol Chem, 1998 - Функция белка SLC27A4 в кишечнике.
  • Mol Cell, 1999 - Роль белка SLC27A4 как основного транспортера жирных кислот.
  • PubMed - Поиск по ключевому слову “SLC27A4” для актуальных статей (PubMed).


Заключение

Ген SLC27A4 играет критическую роль в метаболизме жирных кислот, особенно в транспорте длинноцепочечных жирных кислот.

Мутации гена SLC27A4 связаны с редким заболеванием - синдромом ихтиоза преждевременности, вызывающим кожные и дыхательные проблемы.

Исследования охватывают функциональные аспекты, генетические вариации и фенотипические эффекты, с доступными данными в базах GeneCards, OMIM и PubMed.