Ген SLC27A5

Ген SLC27A5 (Solute Carrier Family 27 Member 5) - Кодирует белок FATP5, участвующий в метаболизме жирных и желчных кислот.

Белок SLC27A5 играет ключевую роль в транспорте длинноцепочечных жирных кислот и конъюгации желчных кислот, преимущественно в печени.

1. Молекулярные характеристики

Ген SLC27A5 расположен на хромосоме 19q13.43 (58,479,512–58,512,413, GRCh38) и охватывает около 33 kb (GeneCards).
Ген SLC27A5 содержит 10 экзонов и кодирует белок FATP5 из 689–690 аминокислот с массой около 75 кДа.
Белок SLC27A5 локализуется в эндоплазматическом ретикулуме и на базальной плазматической мембране гепатоцитов.
Белок SLC27A5 содержит AMP-зависимый синтетазно-лигазный домен и трансмембранные домены.
Ген SLC27A5 высоко экспрессируется в печени, с низкой экспрессией в почках и кишечнике (GTEx Portal).
Ген SLC27A5 участвует в путях синтеза желчных кислот, метаболизма липидов и косвенно метаболизма тирозина.
Ортолог гена SLC27A5 у мышей — Slc27a5, расположен на хромосоме 7.
Паралог гена SLC27A5 — SLC27A2, отличающийся по экспрессии и функциям.

2. Связанные заболевания

Дефицит активности белка SLC27A5 приводит к нарушению конъюгации желчных кислот, вызывая накопление неконъюгированных форм и потенциально холестатические заболевания, такие как доброкачественный рецидивирующий внутрипеченочный холестаз (GeneCards).
Снижение экспрессии гена SLC27A5 в опухолевых тканях коррелирует с прогрессией гепатоцеллюлярной карциномы, усилением эпителиально-мезенхимального перехода и метастазированием (PubMed).
Нокаут гена Slc27a5 у мышей защищает от ожирения за счет нарушения конъюгации желчных кислот.
Ген SLC27A5 ассоциирован с миоэпителиомой и другими метаболическими нарушениями.

3. Последние исследования

Роль SLC27A5 в гепатоцеллюлярной карциноме:

Ген SLC27A5 регулирует альтернативный сплайсинг мРНК PIP4K2A через взаимодействие с IGF2BP3, подавляя метастазирование гепатоцеллюлярной карциномы (PMC).
Ген SLC27A5 способствует ферроптозу, индуцированному сорафенибом, через подавление глутатионредуктазы в гепатоцеллюлярной карциноме.
Дефицит гена SLC27A5 связан с прогрессией гепатоцеллюлярной карциномы через регуляцию альтернативной полиадениляции мРНК METTL14, влияя на стволовость раковых клеток (Bioengineer).
Гиперметилирование гена SLC27A5 увеличивает продукцию ROS и активирует путь KEAP1/NRF2, способствуя прогрессии гепатоцеллюлярной карциномы (Nature).

Метаболизм желчных кислот:

Нокдаун гена Slc27a5 у мышей снижает реконъюгацию желчных кислот, подтверждая роль гена SLC27A5 в энтерогепатической циркуляции (PubMed).
Мыши с нокаутом гена Slc27a5 демонстрируют защиту от ожирения за счет нарушения конъюгации желчных кислот, снижающего накопление липидов (GenScript).

Другие направления:

Ген SLC27A5 необходим для роста внутрипеченочной холангиокарциномы, расширяя его роль в онкологии (PubMed).
Ген SLC27A5 рассматривается как потенциальный биомаркер для диагностики ранней стадии гепатоцеллюлярной карциномы, связанной с HBV.

4. Анализ и синтез данных

Ключевые выводы из исследований:

Ген SLC27A5 регулирует метаболизм жирных и желчных кислот, а также участвует в неканонических процессах, таких как альтернативный сплайсинг и полиадениляция мРНК.
Дефицит гена SLC27A5, вызванный гиперметилированием, связан с прогрессией гепатоцеллюлярной карциномы через активацию онкогенных путей.
Ген SLC27A5 может быть мишенью для усиления ферроптоза в гепатоцеллюлярной карциноме в комбинации с сорафенибом.
Снижение экспрессии гена SLC27A5 коррелирует с плохим прогнозом гепатоцеллюлярной карциномы и может служить биомаркером.

Методологические подходы:

Weighted Gene Co-expression Network Analysis использовалась для идентификации гена SLC27A5 как прогностического маркера гепатоцеллюлярной карциномы (Cancer Cell International).
CRISPR/Cas9 и siRNA применялись для нокаута гена SLC27A5 в клеточных линиях HepG2 для изучения его роли в ферроптозе.
LC-MS и метаболомика использовались для анализа метаболизма желчных кислот с трейсером D(4)-холевой кислоты (PubMed).
Иммунопреципитация с масс-спектрометрией выявила взаимодействие гена SLC27A5 с белками IGF2BP3 и PABPC1 (PMC).

5. Ресурсы для исследователей

Базы данных:

GeneCards - Информация о функциях, путях и экспрессии гена SLC27A5.
NCBI Gene - Последовательности, аннотации и клинические варианты гена SLC27A5.
Ensembl - Геномная локализация и структура экзонов гена SLC27A5.
GTEx Portal - Данные о тканеспецифичной экспрессии гена SLC27A5.
TCGA - Данные об экспрессии и метилировании гена SLC27A5 в гепатоцеллюлярной карциноме.

Экспериментальные инструменты:

CRISPR-клоны для гена SLC27A5 доступны от Applied Biological Materials и VectorBuilder (GeneCards).
siRNA и антитела для гена SLC27A5 предоставляются Abbexa и Boster Bio.
Мышиные модели с нокаутом гена Slc27a5 доступны от Taconic Biosciences.
Рекомбинантный белок SLC27A5 предоставляется Sino Biological.

Публикации:

Front Genet, 2020 - Ген SLC27A5 как прогностический маркер гепатоцеллюлярной карциномы.
Cell Death Dis, 2023 - Роль гена SLC27A5 в ферроптозе.
Adv Sci, 2023 - Альтернативный сплайсинг PIP4K2A гена SLC27A5.
Bioengineer, 2025 - Альтернативная полиадениляция и стволовые клетки.
J Pharm Biomed Anal, 2011 - Метаболизм желчных кислот гена SLC27A5.
PubMed - Поиск по ключевому слову “SLC27A5” для актуальных статей (PubMed).

Заключение

Ген SLC27A5 является многофункциональным регулятором метаболизма жирных и желчных кислот, играющим ключевую роль в гепатоцеллюлярной карциноме.

Его дефицит связан с прогрессией опухолей, нарушением конъюгации желчных кислот и метаболическими патологиями, такими как ожирение.