+7 (953) 870-47-02
Отправить письмо
С 9:00 до 21:00 Без выходных

  • Ваша корзина пуста!

  • Ген SLC46A2

Ген SLC46A2

Ген SLC46A2

Ген SLC46A2 (Solute Carrier Family 46 Member 2) - Кодирует интегральный мембранный белок TSCOT (Thymic Stromal Cotransporter), предположительно функционирующий как Н⁺-зависимый транспортер.

Ген SLC46A2, также известный как TSCOT, является членом семейства SLC46, но его точные субстраты и физиологическая роль остаются недостаточно изученными.


1. Функция гена SLC46A2

Роль в транспорте субстратов:

  • Ген SLC46A2 кодирует белок TSCOT, предположительно действующий как Н⁺-зависимый котранспортер, транспортирующий небольшие молекулы через плазматическую мембрану или мембраны органелл, таких как эндоплазматический ретикулум (PubMed: 10521653).
  • Точные субстраты белка TSCOT не идентифицированы, но предполагается транспортировка фолатов или родственных метаболитов по аналогии с SLC46A1, хотя экспериментальных подтверждений нет (PubMed: 23506898).
  • Белок TSCOT, вероятно, участвует в транспорте липидов или других небольших молекул, учитывая его экспрессию в эпителиальных клетках (PubMed: 23506898).
  • Транспорт белка TSCOT, вероятно, использует градиент протонов, что характерно для семейства SLC46, отличая его от натрий-зависимых или пассивных транспортеров.

Локализация и экспрессия:

  • Ген SLC46A2 расположен на хромосоме 9q32 (Ensembl, NCBI).
  • Белок TSCOT локализован в плазматической мембране и, возможно, в эндоплазматическом ретикулуме эпителиальных и стромальных клеток, включая клетки тимуса (Human Protein Atlas).
  • Низкая экспрессия гена SLC46A2 наблюдается в большинстве тканей, с умеренной экспрессией в печени, почках, толстой кишке и тимусе.
  • Низкая экспрессия гена SLC46A2 характерна для опухолей, без значительных изменений в раке поджелудочной железы, яичников, гепатоцеллюлярной карциноме или раке молочной железы (UALCAN, TCGA).
  • Высокая экспрессия гена SLC46A2 наблюдается в стромальных клетках тимуса, что отражено в названии TSCOT (PubMed: 10521653).
  • Экспрессия гена SLC46A2 может регулироваться метаболическими или иммунными сигналами, но данные ограничены.

Регуляция:

  • Данные о транскрипционных факторах, регулирующих ген SLC46A2, ограничены; возможна регуляция через HIF-1α в условиях гипоксии или факторы, связанные с иммунной регуляцией в тимусе, такие как FOXN1 (PubMed: 34391780).
  • Информация о метилировании промотора гена SLC46A2 отсутствует; гипотетически, гипометилирование может быть связано с экспрессией в тимусе (UALCAN, TCGA).
  • Фосфорилирование (сайты для PKA, PKC) и гликозилирование могут модулировать транспортную активность белка TSCOT, но данные отсутствуют (PubMed: 26383868).
  • Взаимодействие белка TSCOT с другими мембранными белками не изучено.

Биологические процессы:

  • Ген SLC46A2 предположительно участвует в транспорте небольших молекул, таких как метаболиты или липиды, в эпителиальных клетках печени, почек и толстой кишки (PubMed: 10521653).
  • Возможное участие гена SLC46A2 в метаболизме фолатов, аналогично SLC46A1, не подтверждено.
  • Экспрессия гена SLC46A2 в стромальных клетках тимуса предполагает роль в поддержании метаболизма или гомеостаза в T-клеточном микроокружении.
  • Роль гена SLC46A2 в опухолевом микроокружении минимальна из-за низкой экспрессии в опухолях, но он может влиять на метаболизм стромальных клеток.

Связанные сигнальные пути:

  • Потенциальная связь гена SLC46A2 с путем HIF-1α в условиях гипоксии не подтверждена.
  • Возможное взаимодействие гена SLC46A2 с путями, связанными с иммунной регуляцией в тимусе, такими как Notch или FOXN1, не подтверждено.


2. Клиническое значение SLC46A2

Онкология:

  • Экспрессия гена SLC46A2 низкая в большинстве опухолей, включая рак поджелудочной железы, яичников, гепатоцеллюлярную карциному и рак молочной железы (UALCAN, TCGA).
  • Отсутствие значительных изменений экспрессии гена SLC46A2 в опухолях по сравнению с нормальными тканями.
  • Роль гена SLC46A2 в онкологии минимальна из-за низкой экспрессии и отсутствия данных о функциональном значении.
  • Белок TSCOT потенциально может транспортировать метаболиты, влияющие на метаболическую перестройку опухолевых клеток, но это не подтверждено.
  • Ген SLC46A2 не имеет данных о роли в качестве биомаркера или терапевтической мишени в онкологии.

Метаболические расстройства:

  • Ген SLC46A2 предположительно участвует в транспорте метаболитов, возможно фолатов или липидов, в эпителиальных клетках, но субстраты не идентифицированы.
  • Связь гена SLC46A2 с метаболическими расстройствами, такими как дефицит фолатов или дислипидемия, не установлена.

Иммунные и воспалительные заболевания:

  • Экспрессия гена SLC46A2 в стромальных клетках тимуса предполагает участие в поддержании метаболизма или гомеостаза T-клеток, что может влиять на развитие иммунного ответа (PubMed: 10521653).
  • Потенциальная роль гена SLC46A2 в иммунодефицитах или аутоиммунных заболеваниях не изучена.

Другие заболевания:

  • Отсутствуют данные о связи гена SLC46A2 с неврологическими, пигментационными или другими заболеваниями.


3. Последние исследования

Идентификация и характеристика:

  • Kim et al. (2000) впервые описали ген SLC46A2 как предполагаемый транспортер в стромальных клетках тимуса, назвав его TSCOT, но субстраты и механизмы транспорта не были установлены (PubMed: 10521653).
  • Исследование 2013 года показало структурное сходство гена SLC46A2 с SLC46A1, что предполагает возможную роль в транспорте фолатов, но экспериментальных подтверждений нет (PubMed: 23506898).

Онкология:

  • Анализ TCGA выявил низкую экспрессию гена SLC46A2 в большинстве опухолей, что указывает на его минимальную роль в онкологических процессах (UALCAN).
  • Отсутствуют данные о связи гена SLC46A2 с прогрессией опухолей или резистентностью к терапии.

Метаболизм:

  • Ограниченные данные о роли гена SLC46A2 в метаболизме; предполагается участие в транспорте метаболитов в эпителиальных клетках, но субстраты не идентифицированы (PubMed: 10521653).

Модели животных и эксперименты:

  • Нокаут гена Slc46a2 у мышей не описан, что затрудняет понимание его физиологической роли.
  • Экспрессия гена SLC46A2 в клеточных линиях, таких как клетки тимуса, не изучена в достаточной степени.

Взаимодействия белков:

  • Анализы STRING предполагают потенциальное взаимодействие белка TSCOT с другими транспортерами семейства SLC46, такими как SLC46A1 и SLC46A3, и белками, связанными с метаболизмом или иммунной регуляцией, но экспериментальных данных нет (PubMed: 34391780).


4. Потенциальные терапевтические мишени

Иммунные заболевания:

  • Исследование роли гена SLC46A2 в стромальных клетках тимуса может выявить его значение для регуляции T-клеточного гомеостаза и терапии иммунодефицитов или аутоиммунных заболеваний.
  • Экспрессия гена SLC46A2 в тимусе может служить потенциальным биомаркером иммунной функции.

Онкология:

  • Ограниченный терапевтический потенциал гена SLC46A2 из-за низкой экспрессии в опухолях.
  • Изучение гена SLC46A2 в стромальных клетках опухолевого микроокружения может выявить его роль в метаболической поддержке опухолей.

Метаболические расстройства:

  • Идентификация субстратов гена SLC46A2 может оценить его роль в метаболизме фолатов или липидов, что потенциально значимо для терапии дефицита фолатов или дислипидемии.


5. Ограничения и перспективы

  • Точные субстраты гена SLC46A2, такие как фолаты, липиды или другие метаболиты, неизвестны, что ограничивает понимание его функции.
  • Низкая экспрессия гена SLC46A2 в опухолях и большинстве тканей снижает его клиническую значимость.
  • Мутации гена SLC46A2 не описаны в онкологических, метаболических или иммунных заболеваниях (cBioPortal, TCGA).
  • Отсутствуют клинические исследования, таргетирующие ген SLC46A2, из-за недостатка данных о его функции.
  • Идентификация субстратов гена SLC46A2 с использованием метаболомики и функциональных анализов в клеточных линиях, таких как клетки тимуса, является перспективным направлением.
  • Исследование роли гена SLC46A2 в иммунной регуляции в тимусе может способствовать разработке терапий иммунодефицитов.
  • Изучение гена SLC46A2 в стромальных клетках опухолевого микроокружения может выявить его роль в онкологии.
  • Проведение клинических исследований необходимо для оценки гена SLC46A2 как биомаркера иммунной функции.
  • Создание моделей нокаута Slc46a2 у мышей может уточнить его физиологическую и патологическую роль.


6. Источники


Заключение

Ген SLC46A2 Кодирует белок TSCOT, предположительно Н⁺-зависимый транспортер, чьи субстраты и точная физиологическая роль остаются неизвестными.

Высокая экспрессия гена SLC46A2 в стромальных клетках тимуса указывает на потенциальную роль в иммунной регуляции, но его клиническое значение ограничено из-за низкой экспрессии в других тканях и опухолях.

Отсутствие данных о субстратах и мутациях гена SLC46A2 затрудняет его изучение в контексте онкологии и метаболических расстройств.

Перспективы исследований включают идентификацию субстратов с использованием метаболомики, создание нокаут-моделей и изучение роли гена SLC46A2 в иммунной регуляции и опухолевом микроокружении.