Семейство генов SLC47
Семейство генов SLC47 - Кодирует белки MATE1 и MATE2, известные как мультидозовые и токсиноэкструзионные транспортеры (MATE), участвующие в выведении катионных лекарств, токсинов и эндогенных метаболитов.
Гены SLC47A1 и SLC47A2 относятся к суперсемейству главных фасилитаторов и играют ключевую роль в фармакокинетике, особенно в почках и печени, используя градиент протонов для активного транспорта.
1. Функция генов SLC47
Роль в транспорте субстратов:
- Ген SLC47A1 кодирует белок MATE1, локализованный на апикальной мембране гепатоцитов в желчных канальцах и проксимальных канальцев почек (PubMed: 18676680).
- Белок MATE1 транспортирует катионные и цвиттерионные субстраты, такие как метформин, креатинин, гуанидин, прокайнамид, циметидин и эндогенные метаболиты, включая тиамин и N-метилникотинамид (PubMed: 18676680).
- Белок MATE1 использует градиент H⁺ для выведения субстратов в мочу или желчь, работая как антипортер H⁺:субстрат (PubMed: 18676680).
- Ген SLC47A2 кодирует белок MATE2/MATE2-K, преимущественно экспрессируемый в почках на апикальной мембране проксимальных канальцев (PubMed: 20858707).
- Белок MATE2/MATE2-K транспортирует катионные лекарства, такие как метформин, окалиплатин, цисплатин, тетраэтиламмоний, и другие субстраты (PubMed: 20858707).
- Белок MATE2-K является почечным изоформом, специфичным для выведения катионных лекарств в мочу (PubMed: 20858707).
- Белки MATE1 и MATE2 взаимодействуют с транспортерами SLC22, такими как OCT1 и OCT2, обеспечивая поглощение катионов в клетки, в то время как MATE1/2 выводят их, обеспечивая трансклеточный транспорт (PubMed: 23506898).
Локализация и экспрессия:
- Ген SLC47A1 расположен на хромосоме 17p11.2 (Ensembl, NCBI).
- Ген SLC47A2 расположен на хромосоме 17p11.2, рядом с SLC47A1, что указывает на генную дупликацию (Ensembl, NCBI).
- Белок MATE1 локализован на апикальной мембране гепатоцитов и проксимальных канальцев почек, а также обнаружен в скелетных мышцах, надпочечниках и яичках (Human Protein Atlas).
- Белок MATE2 преимущественно локализован на апикальной мембране проксимальных канальцев почек, с низкой экспрессией в других тканях (Human Protein Atlas).
- Ген SLC47A1 имеет высокую экспрессию в печени и почках, умеренную — в надпочечниках и скелетных мышцах.
- Ген SLC47A2 демонстрирует высокую экспрессию в почках и низкую в других тканях.
- Гены SLC47A1 и SLC47A2 имеют низкую экспрессию в большинстве опухолей, включая рак поджелудочной железы, яичников, гепатоцеллюлярную карциному и рак молочной железы, за исключением умеренной экспрессии SLC47A1 в гепатоцеллюлярной карциноме (UALCAN, TCGA).
- Экспрессия генов SLC47A1 и SLC47A2 регулируется метаболическими и фармакологическими факторами, включая ингибиторы, такие как циметидин и пириметамин.
Регуляция:
- Ген SLC47A1 регулируется транскрипционными факторами HNF4α и NRF2, связанными с метаболизмом ксенобиотиков и стрессовыми ответами (PubMed: 26397862).
- Ген SLC47A2 регулируется факторами HNF1β и PXR, что связано с почечной экспрессией и выведением лекарств (PubMed: 20858707).
- Гипометилирование промоторов генов SLC47A1 и SLC47A2 в печени и почках способствует их высокой экспрессии в этих тканях (UALCAN, TCGA).
- Гиперметилирование промоторов генов SLC47A1 и SLC47A2 в опухолях, таких как рак яичников и поджелудочной железы, может снижать их экспрессию.
- Фосфорилирование (сайты для PKA, PKC) может модулировать активность белков MATE1 и MATE2 (PubMed: 26383868).
- Взаимодействие белков MATE1 и MATE2 с лизосомальными белками или транспортерами, такими как SLC22A2/OCT2, влияет на их функцию.
Биологические процессы:
- Гены SLC47A1 и SLC47A2 участвуют в выведении эндогенных метаболитов, таких как креатинин и тиамин, и ксенобиотиков, поддерживая гомеостаз катионов в организме.
- Гены SLC47A1 и SLC47A2 играют ключевую роль в фармакокинетике метформина, обеспечивая его выведение через почки и печень (PubMed: 18676680).
- Белки MATE1 и MATE2 обеспечивают выведение катионных лекарств, таких как цисплатин и окалиплатин, влияя на их токсичность и эффективность (PubMed: 20858707).
- Взаимодействия белков MATE1 и MATE2 с ингибиторами, такими как циметидин, могут вызывать лекарственные взаимодействия, увеличивая концентрацию субстратов в плазме (PubMed: 20858707).
- Роль генов SLC47A1 и SLC47A2 в опухолевом микроокружении минимальна из-за низкой экспрессии, но они могут влиять на выведение химиотерапевтических препаратов, таких как цисплатин (PubMed: 34391780).
Связанные сигнальные пути:
- Путь NRF2 регулирует экспрессию гена SLC47A1 в ответ на окислительный стресс.
- Пути PXR/CAR регулируют экспрессию генов SLC47A1 и SLC47A2 в контексте метаболизма ксенобиотиков.
- Потенциальная связь генов SLC47A1 и SLC47A2 с путем PI3K/AKT может влиять на метаболизм метформина в диабете.
2. Клиническое значение SLC47
Онкология:
- Гены SLC47A1 и SLC47A2 имеют низкую экспрессию в большинстве опухолей, включая рак поджелудочной железы, яичников, гепатоцеллюлярную карциному и рак молочной железы, за исключением умеренной экспрессии SLC47A1 в гепатоцеллюлярной карциноме (UALCAN, TCGA).
- Дифференциальная экспрессия гена SLC47A1 наблюдается в раке поджелудочной железы по сравнению с нормальными тканями (p<0.05) (PMC8848431).
- Белки MATE1 и MATE2 участвуют в выведении химиотерапевтических препаратов, таких как цисплатин и окалиплатин, что может влиять на их эффективность и токсичность в опухолевых клетках (PubMed: 20858707).
- Гены SLC47A1 и SLC47A2 могут играть роль в резистентности к платиновым препаратам за счет выведения их из клеток, но данные ограничены.
- Ген SLC47A1 может быть прогностическим маркером в раке поджелудочной железы, но его значение ограничено из-за низкой экспрессии (PMC8848431).
- Отсутствуют данные о роли гена SLC47A2 как биомаркера или терапевтической мишени в онкологии.
Метаболические расстройства:
- Гены SLC47A1 и SLC47A2 играют ключевую роль в фармакокинетике метформина, влияя на его клиренс и эффективность при лечении диабета 2 типа (PubMed: 18676680).
- Белки MATE1 и MATE2 участвуют в выведении креатинина, что важно для оценки функции почек.
- Полиморфизмы гена SLC47A1 (например, rs2289669) и гена SLC47A2 (например, rs12943590) связаны с вариабельностью ответа на метформин и риском побочных эффектов, таких как лактоацидоз (PubMed: 20858707).
- Гены SLC47A1 и SLC47A2 имеют потенциальную роль в лечении ожирения и неалкогольной жировой болезни печени за счет регуляции метаболизма ксенобиотиков (Frontiers 2024).
Иммунные и воспалительные заболевания:
- Роль генов SLC47A1 и SLC47A2 в иммунной регуляции минимальна из-за низкой экспрессии в иммунных клетках.
- Связь генов SLC47A1 и SLC47A2 с воспалительными процессами не установлена.
Фармакологические взаимодействия:
- Гены SLC47A1 и SLC47A2 являются мишенями для лекарственных взаимодействий; ингибиторы, такие как циметидин, пириметамин и долутегравир, могут снижать выведение метформина, увеличивая его концентрацию в плазме и риск токсичности (PubMed: 26397862).
- Белки MATE1 и MATE2 важны для выведения цисплатина и окалиплатина, что влияет на их нефротоксичность и эффективность в онкологии (PubMed: 20858707).
3. Последние исследования
Фармакокинетика:
- Исследования 2023 года подтвердили, что полиморфизмы гена SLC47A1 (rs2289669) и гена SLC47A2 (rs12943590) влияют на фармакокинетику метформина, изменяя его почечный клиренс и терапевтическую эффективность (PubMed: 26397862).
- Исследования 2024 года подтвердили роль гена SLC47A1 в выведении окалиплатина, что может быть связано с резистентностью к химиотерапии в раке толстой кишки (PubMed: 39363015).
Онкология:
- Анализ TCGA выявил дифференциальную экспрессию гена SLC47A1 в раке поджелудочной железы, но его прогностическое значение ограничено (p<0.05) (PMC8848431).
- Отсутствуют данные о роли гена SLC47A2 в онкологии, за исключением потенциального участия в выведении платиновых препаратов.
Метаболизм:
- Гены SLC47A1 и SLC47A2 участвуют в транспорте эндогенных метаболитов, таких как креатинин и тиамин, что важно для поддержания метаболического гомеостаза (PubMed: 18676680).
- Исследования на моделях мышей с нокаутом гена Slc47a1 показали увеличение плазменной концентрации метформина и снижение его почечного клиренса (PubMed: 20858707).
Взаимодействия белков:
- Анализы STRING предполагают взаимодействие белков MATE1 и MATE2 с транспортерами SLC22A1 (OCT1), SLC22A2 (OCT2) и лизосомальными белками, что подтверждает их роль в трансклеточном транспорте катионов (PubMed: 34391780).
4. Потенциальные терапевтические мишени
Онкология:
- Ингибирование генов SLC47A1 и SLC47A2 может повысить концентрацию платиновых препаратов, таких как цисплатин, в опухолевых клетках, что может преодолеть резистентность.
- Ген SLC47A1 может служить биомаркером для оценки фармакокинетики химиотерапии в гепатоцеллюлярной карциноме и раке поджелудочной железы.
Метаболические расстройства:
- Генотипирование полиморфизмов генов SLC47A1 и SLC47A2 может оптимизировать дозировку метформина и минимизировать побочные эффекты при лечении диабета.
- Исследование роли генов SLC47A1 и SLC47A2 в метаболизме ксенобиотиков может способствовать лечению неалкогольной жировой болезни печени и ожирения (Frontiers 2024).
Фармакологические взаимодействия:
- Разработка стратегий для минимизации лекарственных взаимодействий с ингибиторами генов SLC47A1 и SLC47A2, такими как циметидин и пириметамин, может улучшить безопасность метформина и платиновых препаратов.
5. Ограничения и перспективы
- Низкая экспрессия генов SLC47A1 и SLC47A2 в опухолях ограничивает их роль в онкологии, за исключением выведения химиотерапевтических препаратов.
- Хотя метформин и платиновые препараты хорошо изучены как субстраты, другие эндогенные субстраты белков MATE1 и MATE2 требуют идентификации.
- Мутации генов SLC47A1 и SLC47A2 редко описаны в онкологии или метаболических заболеваниях (cBioPortal, TCGA).
- Ограниченное число клинических исследований таргетирует гены SLC47A1 и SLC47A2, несмотря на их фармакологическую значимость.
- Идентификация новых субстратов генов SLC47A1 и SLC47A2 с использованием метаболомики может расширить понимание их роли в метаболизме.
- Разработка ингибиторов генов SLC47A1 и SLC47A2 может повысить эффективность химиотерапии, такой как цисплатин, в онкологии.
- Исследование полиморфизмов генов SLC47A1 и SLC47A2 в популяциях может способствовать персонализированной терапии диабета и онкологических заболеваний.
- Проведение клинических исследований необходимо для оценки гена SLC47A1 как биомаркера в гепатоцеллюлярной карциноме и раке поджелудочной железы.
- Создание моделей нокаута генов Slc47a1 и Slc47a2 у мышей может уточнить их роль в метаболизме и фармакокинетике.
6. Источники
- PubMed: 18676680.
- PubMed: 20858707.
- PubMed: 23506898.
- PubMed: 26397862.
- PubMed: 34391780.
- PubMed: 39363015.
- GeneCards: SLC47A1 - Генетические данные и аннотации гена SLC47A1.
- GeneCards: SLC47A2 - Генетические данные и аннотации гена SLC47A2.
- Human Protein Atlas: SLC47A1 - Данные об экспрессии и локализации белка MATE1.
- Human Protein Atlas: SLC47A2 - Данные об экспрессии и локализации белка MATE2.
- UALCAN - Анализ экспрессии в опухолях (TCGA).
- Frontiers 2024 - Роль SLC47 в метаболизме ксенобиотиков.
- PMC8848431 - Дифференциальная экспрессия SLC47A1 в раке поджелудочной железы.
- Источник - Дополнительные веб-данные.
Заключение
Семейство генов SLC47 Кодирует белки MATE1 и MATE2, которые играют ключевую роль в выведении катионных лекарств и эндогенных метаболитов, особенно метформина, через почки и печень.
Гены SLC47A1 и SLC47A2 имеют ограниченную роль в онкологии из-за низкой экспрессии в опухолях, но могут влиять на фармакокинетику химиотерапевтических препаратов, таких как цисплатин и окалиплатин.
Полиморфизмы этих генов значимы для персонализированной терапии диабета, а их взаимодействие с ингибиторами подчеркивает важность учета лекарственных взаимодействий.
Перспективы исследований включают идентификацию новых субстратов, разработку ингибиторов для повышения эффективности химиотерапии и создание нокаут-моделей для изучения их роли в метаболизме и фармакокинетике.